HIV感染分为急性期、无症状期和艾滋病期。急性期多在初次感染后2-4周，症状轻微，发热等可自行缓解；无症状期可由急性期进入或直接进入，持续6-8年不等，体内HIV持续复制有传染性；艾滋病期有严重免疫缺陷表现，儿童生长发育迟缓，女性易合并其他感染，有呼吸系统、消化系统、中枢神经系统等机会性感染及卡波西肉瘤、非霍奇金淋巴瘤等肿瘤。
一般症状：通常发生在初次感染HIV后2-4周左右。大部分患者临床症状轻微，以发热最为常见，可伴有咽痛、盗汗、恶心、呕吐、腹泻、皮疹、关节痛、淋巴结肿大及神经系统症状等。发热可为低热，一般持续1-3周后可自行缓解。皮疹多为斑丘疹或荨麻疹，不痛不痒，一般1-2周消退。
无症状期
此期特点：可由急性期进入此期，或无明显急性期症状而直接进入此期。此期持续时间一般为6-8年，但也有短至数月，长至15年的情况。此期患者无明显症状，但体内的HIV在持续复制，具有传染性。年龄对无症状期的进展影响不大，但生活方式如是否规律作息、是否有其他基础疾病等会影响免疫功能的下降速度，进而影响无症状期的长短。有基础疾病或生活不规律者可能进展更快。
艾滋病期
严重免疫缺陷表现：
年龄与性别影响：儿童患者在艾滋病期可能生长发育迟缓，表现出特殊的面容等。女性患者在这一时期可能因免疫功能低下更容易合并其他感染性疾病。
机会性感染：
呼吸系统：肺孢子菌肺炎是艾滋病患者最常见的机会性感染之一，表现为发热、干咳、进行性呼吸困难，影像学检查可见双肺间质性肺炎。
消化系统：白色念珠菌引起的食管炎、肠炎较为常见，食管炎表现为吞咽疼痛，肠炎表现为慢性腹泻，每日数次至十余次，可伴有腹痛、消瘦等。
中枢神经系统：可出现隐球菌脑膜炎，表现为头痛、发热、呕吐、意识障碍等；也可出现弓形虫脑病，表现为头痛、癫痫发作、意识障碍等。
肿瘤：常见的有卡波西肉瘤，多见于皮肤，表现为紫红色或蓝紫色的斑疹、丘疹或结节，可融合成片；还有非霍奇金淋巴瘤等，可累及多个部位，出现相应的症状，如淋巴结肿大、压迫症状等。
