小儿肿瘤的发生与遗传因素、胚胎发育异常、病毒感染、环境因素和免疫因素相关。部分小儿肿瘤具遗传倾向，胚胎发育受干扰可致肿瘤，某些病毒感染关联小儿肿瘤，化学物质接触、辐射暴露等环境因素可增发病风险，自身免疫未完善或免疫缺陷时易患肿瘤。
胚胎发育异常
在胚胎发育时期，如果受到某些因素干扰，可能导致组织细胞异常分化，进而引发肿瘤。例如，Wilms瘤（肾母细胞瘤）被认为与胚胎期肾脏组织的发育异常有关，在胚胎发育过程中，肾脏的某些前体细胞没有正常分化成熟，而是持续增殖，最终形成肿瘤。这种胚胎发育异常可能是由于胚胎时期的基因突变、环境因素影响等多种原因共同作用导致的。孕妇在孕期的一些不良因素，如接触某些致畸物质等，可能会增加胎儿发生胚胎发育异常相关肿瘤的风险。
病毒感染
某些病毒感染与小儿肿瘤的发生有一定关联。例如，EB病毒与伯基特淋巴瘤和鼻咽癌等小儿肿瘤的发生相关。EB病毒感染人体后，会整合到宿主细胞的基因组中，影响细胞的生长调控机制，导致细胞异常增殖。研究发现，在伯基特淋巴瘤患者的肿瘤组织中常常可以检测到EB病毒的基因组。对于儿童来说，感染相关病毒后，如果机体的免疫监控功能不能及时有效地清除受感染的细胞，就可能逐渐发展为肿瘤。
环境因素
化学物质接触：儿童长期接触某些化学物质可能增加肿瘤发病风险。比如，长期接触苯等有机溶剂的儿童，患白血病的概率可能升高。这些化学物质可以损伤细胞的DNA，导致基因突变，影响细胞的正常生长和分化。另外，一些农药残留等环境中的化学污染物，如果儿童摄入或长期接触，也可能对身体产生不良影响，增加肿瘤发生的可能性。孕妇在孕期如果接触了有害化学物质，也可能通过胎盘影响胎儿，增加胎儿日后患肿瘤的风险。
辐射暴露：过度的辐射暴露是小儿肿瘤的危险因素之一。例如，儿童时期接受过胸部放疗的个体，日后患甲状腺癌等肿瘤的风险增加。此外，长期处于辐射环境中，如生活在核辐射污染区域附近，或者频繁进行胸部X线等辐射检查（虽然诊断性辐射剂量通常较低，但多次频繁接触也可能有潜在影响），都可能使儿童细胞中的染色体发生畸变，影响细胞的正常功能，从而引发肿瘤。
免疫因素
儿童自身免疫系统发育尚未完善，免疫监视功能相对较弱时，容易发生肿瘤。例如，免疫缺陷病患儿，由于机体不能有效地识别和清除突变的细胞，肿瘤的发生率明显高于正常儿童。常见的原发性免疫缺陷病如严重联合免疫缺陷病等，患儿的T细胞、B细胞等免疫细胞功能严重异常，这使得他们对肿瘤细胞的监视和清除能力大幅下降，更容易患上白血病、淋巴瘤等肿瘤性疾病。对于免疫功能低下的儿童，需要采取更加严密的防护措施，避免接触可能诱发肿瘤的因素，并定期进行健康筛查。
