肛瘘症状主要表现为肛门周围反复出现的流脓、疼痛、瘙痒，症状可持续数周至数月，甚至长期反复。
- 低位肛瘘症状：外口距肛门较近（约3cm内），瘘管多为直型，主要症状为肛门周围皮肤反复破溃流脓，脓液量较少，局部可触及条索状瘘管，疼痛较轻，多为持续性隐痛。
- 高位肛瘘症状：外口距肛门较远（超过3cm），瘘管走行复杂，可累及肛门括约肌，常伴有明显疼痛，尤其在排便或行走时加重，脓液量较多且伴有臭味，易出现肛门周围皮肤潮湿、瘙痒，长期反复发作可能导致肛门功能受损。
- 复杂性肛瘘症状：存在多个外口或瘘管分支，症状更复杂，常伴有肛门周围反复感染、肿胀、疼痛，瘘管可能累及肛门直肠环，导致排便功能障碍，愈合困难，病程较长。
- 结核性肛瘘症状：多继发于结核感染，病程长，进展缓慢，外口分泌物稀薄，呈米泔水样，伴有低热、盗汗、乏力等全身症状，瘘管边缘不整齐，质地较硬，愈合能力差。
特殊人群注意事项：婴幼儿肛瘘较少见，多因肛周脓肿未及时治疗发展而来，需家长密切观察，及时就医；老年人因身体机能下降，感染控制能力弱，肛瘘症状可能更严重，愈合时间长，需加强营养支持，避免久坐，保持局部清洁干燥。
