肛瘘有流脓、肿痛、瘙痒及全身症状等表现，流脓量与类型、病程等有关，儿童患者有其特点；肿痛程度不一，老年人、儿童有不同表现；瘙痒因脓液刺激，糖尿病患者等更严重；单纯性肛瘘全身症状不明显，复杂性感染时会有全身症状，且生活方式会影响症状。
表现：肛瘘最常见的症状之一是肛门周围间断或持续流脓，脓液量多少不一。新形成的肛瘘流脓较多，脓液黏稠、黄色、有臭味；时间较久的肛瘘流脓量较少，有时呈间歇性流脓。
影响因素：与肛瘘的类型、病程等有关，如低位单纯性肛瘘流脓相对较有规律，高位复杂性肛瘘可能因瘘管分支多，流脓情况较复杂。对于儿童患者，由于其身体代谢等特点，可能在感染急性期流脓更明显，而慢性期可能时有时无。
肿痛
表现：当肛瘘引流不畅时会出现肿痛，尤其是急性发作期。疼痛程度不一，可为胀痛、跳痛等。局部可出现红肿，压痛明显。
影响因素：不同人群中，老年人可能因身体机能下降，对疼痛的耐受和反应与年轻人不同，肿痛可能持续时间相对较长；儿童肛瘘患者由于表达能力等因素，可能表现为哭闹不安等异常行为来提示局部肿痛。
瘙痒
表现：由于脓液不断刺激肛门周围皮肤，患者会感到肛门周围瘙痒，皮肤可出现湿疹样改变，如潮湿、潮红、粗糙等。
影响因素：长期的脓液刺激是主要原因，对于有糖尿病等基础疾病的患者，由于自身血糖等代谢异常，皮肤抵抗力下降，可能更容易出现瘙痒且症状相对更严重；儿童患者皮肤娇嫩，瘙痒可能导致搔抓，进而加重皮肤损伤和感染风险。
全身症状
表现：一般单纯性肛瘘全身症状不明显，当肛瘘复杂性感染，形成脓肿等情况时，可出现发热、畏寒、乏力等全身症状。
影响因素：成年人与儿童在全身症状的表现和程度上有所不同，儿童免疫系统相对不完善，感染后全身症状可能更易出现且更明显，如发热可能较为突出；对于有基础疾病的患者，如合并免疫缺陷疾病，全身症状可能更严重且不易控制。
此外，肛瘘患者在不同生活方式下，症状可能有一定变化，如久坐、劳累等可能加重局部肿痛和流脓等症状，而保持肛门清洁等良好生活方式有助于减轻症状。
