肛瘘的症状包括流脓，新瘘管生成时流脓增多，脓液性质随瘘管情况变化，儿童、不同性别肛瘘患者流脓表现有差异，生活方式等会影响；疼痛，瘘管感染或脓液排出不畅时会痛，儿童、女性及不同生活方式下疼痛表现不同；瘙痒，脓液刺激致肛周瘙痒，儿童、女性及生活方式等影响瘙痒程度；肿块，较大肛瘘可触及索条状硬块，儿童、女性及生活方式等对肿块有影响；全身症状，一般无全身症状，反复发作感染扩散时可出现发热等全身感染症状，儿童、女性及生活方式等影响全身症状表现。
是肛瘘的主要症状，脓液的多少与瘘管的长短、多少有关。新生成的肛瘘流脓较多，脓液粘稠、黄色、有臭味；时间长久的排脓较少，或时有时无，脓液白色、稀薄；若脓液突然增多，则表示有新瘘管生成。瘘管有时会排出气体或粪便。
对于儿童患者，由于其身体代谢相对旺盛，且肛瘘相关炎症可能刺激肠道功能，流脓情况可能与成人有一定差异，但总体遵循上述脓液性质随瘘管情况变化的规律。不同性别肛瘘患者在流脓症状上无明显差异，但女性由于会阴部解剖结构特点，肛瘘位置若靠近阴道等部位，在观察和护理上需更谨慎。生活方式方面，长期久坐、不注意肛周清洁等可能导致肛瘘局部感染加重，使流脓症状更明显。有肛瘘病史的患者，若近期生活作息紊乱、抵抗力下降，也容易出现流脓增多的情况。
疼痛
一般肛瘘常无疼痛，当瘘管感染或脓液排出不畅而肿胀发炎时，可引起疼痛。内瘘时常感到直肠下部和肛门部灼热不适，排便时疼痛加重。
儿童对疼痛的感知和表达与成人不同，可能表现为哭闹不安等情况。女性在月经期间等特殊时期，身体抵抗力相对下降，肛瘘疼痛可能会较平时敏感。生活方式上，过度劳累、剧烈运动等可能诱发肛瘘疼痛加重。有肛瘘病史者，若在疼痛时未及时采取合适的肛周护理措施，疼痛可能进一步加剧。
瘙痒
因脓液不断刺激肛周皮肤，患者常感瘙痒，肛周皮肤可出现潮湿、皮疹等改变。
儿童肛周皮肤较为娇嫩，肛瘘引起的瘙痒可能导致儿童不自觉搔抓肛周，进而加重皮肤损伤和感染风险。女性由于生理结构，肛周汗腺、皮脂腺分布等与男性有差异，瘙痒时的表现和护理需考虑这些因素。生活方式中，不注意肛周清洁，汗液、分泌物等与脓液混合，会加重瘙痒症状。有肛瘘病史者，若肛周卫生状况差，瘙痒会更明显，且可能影响生活质量。
肿块
较大的肛瘘可在肛周触及索条状硬块，按压有轻度疼痛。
儿童肛瘘相对较少见，但一旦出现肿块，由于其表述能力有限，需家长密切观察其肛周情况。女性肛瘘患者的肿块位置若靠近会阴部特殊结构，在判断和处理时要格外小心。生活方式上，久坐等可能导致肛周血液循环不畅，使肿块相关症状加重。有肛瘘病史者，肿块情况可能随病情变化而改变，需定期关注。
全身症状
一般肛瘘无全身症状，当肛瘘反复发作、感染扩散时，可出现发热、寒战、乏力等全身感染症状。
儿童身体抵抗力较弱，肛瘘感染扩散时全身症状可能更明显，如高热等情况相对成人更易出现。女性在经期等免疫力相对低的时期，肛瘘感染扩散引发全身症状的风险可能增加。生活方式中，营养不良、过度疲劳等会影响身体抵抗力，使肛瘘更易出现全身感染症状。有肛瘘病史者，若本身存在基础疾病或生活方式不健康，在肛瘘复发时全身症状可能更严重。
