百日咳的“百日”并非指固定100天，而是形容其典型咳嗽症状的持续周期，医学上通常指从阵发性痉挛性咳嗽开始至症状缓解约6-8周（42-56天），此阶段咳嗽逐渐加重后减轻，传染性最高。
病程特点与典型持续时间。“百日”核心是描述咳嗽症状的渐进发展过程，医学观察显示，从咳嗽开始到痉挛性咳嗽高峰期，再到症状自然缓解，多数患者需经历6-8周，期间咳嗽强度先升后降，但未治疗者可能延长至2-3个月，需重点防护传染性。
婴幼儿与成人的病程差异。婴幼儿（＜2岁）因免疫功能尚未完善，气道发育不成熟，病程可能延长至8-10周，且易并发肺炎、呼吸暂停等重症，部分需住院监护；成人及青少年因免疫基础较好，病程通常4-6周，但仍具传染性，需注意防护。
影响病程的关键因素。发病早期（4周内）规范使用抗生素可缩短病程至4周左右，未及时治疗者病程延长至2个月以上；年龄越小、免疫力低下或合并基础疾病（如哮喘、心脏病）者，病程更易延长，需加强呼吸支持与营养干预。
特殊人群的病程管理。孕妇感染百日咳可能增加早产、胎儿宫内窘迫风险，需在72小时内就医，避免剧烈咳嗽；老年人及慢性病患者病程可能持续8周以上，需重视氧疗与并发症监测；全程规范接种疫苗可使接种者病程缩短至3-4周，显著降低重症率。
