扁桃体结石清理需根据结石大小、症状及患者情况选择方式。小结石可通过日常口腔护理（如盐水漱口）、轻柔刷牙或使用水牙线尝试排出；若结石较大、反复引发不适或感染，需就医由专业人员采用器械取出或手术治疗。
日常护理清理法：每日用温盐水（250ml水+半茶匙盐）漱口2~3次，每次含漱30秒，可减少结石形成并松动微小结石。同时，用软毛牙刷轻柔刷洗扁桃体区域，或使用冲牙器（水流压力调至低档位）轻柔冲洗扁桃体隐窝，注意动作幅度避免损伤黏膜。
药物辅助清理法：若扁桃体炎症反复发作伴随结石增多，可在医生指导下短期使用含氯己定等成分的口腔含漱液，帮助抑制口腔细菌，减少结石附着风险。但药物无法直接溶解已形成的结石，需配合物理清理方法。
专业医疗干预法：若结石长期滞留、引发吞咽困难、口臭或反复感染，应及时就诊。医生可能使用镊子、吸引器等工具直接取出结石，或在必要时采用扁桃体切除术（适用于反复发病者）。手术需由专业医生评估，尤其注意儿童扁桃体未完全发育前的干预需谨慎。
特殊人群注意事项：儿童（尤其是3岁以下）不建议自行清理结石，避免操作不当损伤扁桃体。孕妇或哺乳期女性若需治疗，需提前咨询产科医生，优先选择安全的保守治疗方式。糖尿病患者因免疫力较弱，需更严格控制口腔卫生，避免结石引发感染加重病情。
