肺结核治疗不彻底可能导致肺部病变迁延不愈、结核菌耐药、播散至其他器官引发结核性脑膜炎、骨结核等严重并发症，还可能增加传染他人风险，甚至影响肺功能和生活质量。
肺部病变迁延与进展：未彻底治愈的结核病灶可能形成纤维化、空洞或钙化，导致肺部结构永久损伤，肺通气功能下降，出现慢性咳嗽、咳痰、呼吸困难等症状，反复感染风险升高。
结核菌耐药性产生：治疗中断或不规范用药会使结核菌发生变异，产生耐药性，后续治疗需更换更高级别药物，治疗周期延长、难度增加，且耐药菌传播可能引发局部或社区流行。
全身播散性结核：结核菌可通过血液或淋巴系统扩散至脑、骨、肾、脊柱等部位，引发结核性脑膜炎（表现为头痛、高热、意识障碍）、骨结核（关节疼痛、活动受限）、肾结核（血尿、肾功能损害）等，严重时危及生命。
特殊人群风险加剧：老年患者免疫力低下，治疗不彻底易并发呼吸衰竭；糖尿病患者因代谢紊乱，结核菌更易繁殖，耐药风险更高；儿童患者若治疗不足，可能影响生长发育，遗留肺部或全身后遗症。
传染风险持续存在：未转阴的患者痰液中仍含结核菌，持续向环境排菌，增加家人、医护人员感染结核的概率，尤其在密闭环境中传播风险显著升高。
