非典型性肺炎的病原体主要包括严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）及部分细菌（如肺炎支原体、肺炎衣原体）和真菌（罕见）。
1.严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）：2002-2003年全球SARS疫情的病原体，通过呼吸道飞沫传播，潜伏期2~10天，可引发发热、干咳、呼吸困难等症状，重症率约15%，致死率约9%。
2.中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）：2012年首次在沙特阿拉伯发现，传播途径以接触感染动物分泌物为主，临床表现类似SARS但肺部病变更重，免疫功能低下者风险更高，致死率约34%。
3.肺炎支原体：介于细菌和病毒之间的病原体，通过呼吸道传播，多见于儿童及青少年，症状较轻但病程长，可引发发热、咳嗽、咽痛等，大环内酯类抗生素治疗有效。
4.肺炎衣原体：全球分布，易感人群以儿童、老年人及免疫缺陷者为主，表现为发热、干咳、咽痛，四环素类或大环内酯类抗生素可有效控制感染。
特殊人群注意：老年人、孕妇及有基础疾病（如糖尿病、心脏病）者感染后需密切监测，儿童应避免前往人群密集场所，出现症状及时就医，治疗以对症支持为主，药物需遵医嘱使用。
