体格检查包含生殖器官外观检查观察阴茎等情况、第二性征检查查看相关特征；实验室检查有精液常规检查各项指标及血液检查性激素等指标和其他血液指标；影像学检查有阴囊超声检查睾丸等情况、前列腺超声了解前列腺情况；还有尿道镜检查用于检查尿道病变，不同年龄阶段男性各检查情况因年龄有差异且受生活方式、病史等影响。
生殖器官外观检查：观察阴茎的大小、形态、有无畸形、包皮是否过长或包茎，阴囊的大小、对称性，睾丸的大小、质地、位置等。例如正常成年男性阴茎长度（非勃起状态）一般在4-8厘米，勃起后可达到8-18厘米，睾丸通常呈椭圆形，左右各一，质地较韧。不同年龄阶段男性生殖器官发育有差异，儿童期生殖器官未发育，青春期开始逐渐发育成熟，成年后基本定型。有特殊生活方式如长期久坐可能影响生殖器官血液循环，病史中有生殖系统外伤史者需重点检查相关部位外观情况。
第二性征检查：查看胡须、腋毛、阴毛的分布情况，声音的音调，肌肉发达程度等。男性第二性征在青春期由雄激素刺激发育，不同年龄男性第二性征表现不同，儿童期第二性征不明显，青春期逐渐出现并趋于成熟，成年后相对稳定。有内分泌疾病病史者可能出现第二性征异常，如雄激素分泌异常可能导致第二性征发育不全或异常。
实验室检查
精液常规检查：包括精液量、精子密度、精子活力（前向运动精子百分比等）、精子形态等指标。正常精液量一般为2-6毫升，精子密度应≥15×10?/ml，前向运动精子（a级+b级）应≥32%，正常形态精子应≥4%。不同生活方式如长期吸烟、酗酒可能影响精液质量，有生殖系统感染病史者精液常规可能出现异常，如白细胞增多等情况。检查前需禁欲2-7天，不同年龄男性精液参数有差异，随着年龄增长，精液质量可能逐渐下降。
血液检查
性激素检查：包括睾酮、雌二醇、促黄体生成素、促卵泡生成素等。睾酮是男性重要的雄激素，成年男性睾酮正常范围一般在12-35nmol/L，不同年龄阶段男性性激素水平不同，儿童期性激素水平低，青春期开始升高并逐渐稳定在成年水平，老年男性性激素水平可能下降。有内分泌疾病如垂体疾病可能影响性激素分泌，生活方式中长期熬夜可能干扰激素分泌节律。
其他血液指标：如血常规可了解有无感染、贫血等情况，肝肾功能检查可评估肝肾功能对生殖相关代谢的影响等。有肝肾疾病病史者这些指标可能异常，不同年龄男性肝肾功能随年龄有一定变化趋势。
影像学检查
超声检查
阴囊超声：可检查睾丸、附睾、精索静脉等情况。能发现睾丸、附睾的炎症、肿瘤、囊肿，精索静脉曲张等。正常睾丸超声表现为实质均匀的低回声，附睾紧贴睾丸上极，精索静脉在平静呼吸时一般看不到明显曲张，valsalva试验时可观察到精索静脉扩张。不同年龄男性阴囊超声表现有差异，儿童期阴囊内结构相对简单，青春期后逐渐清晰，成年后若有相关疾病可通过超声发现异常。有阴囊部位外伤或疼痛病史者需重点进行阴囊超声检查。
前列腺超声：了解前列腺的大小、形态、有无增生、结石、占位等情况。正常前列腺大小约4×3×2厘米，呈栗子形，内部回声均匀。不同年龄男性前列腺大小不同，老年男性随着年龄增长，前列腺增生发病率逐渐升高，超声表现为前列腺体积增大，内部回声不均等。有下尿路症状如尿频、尿急、排尿困难等病史者需进行前列腺超声检查。
尿道镜检查
用于检查尿道有无狭窄、炎症、肿瘤等病变。可直接观察尿道黏膜情况，对于有排尿困难、尿道分泌物等症状的男性，怀疑尿道病变时可进行尿道镜检查。检查前需进行局部麻醉等准备，不同年龄男性尿道结构随发育成熟而固定，儿童期尿道较细，成年后尿道管径相对稳定，有尿道外伤或反复尿道感染病史者可能需要进行尿道镜检查。
