体格检查包含外生殖器检查观察阴茎大小形态等及第二性征检查查看毛发分布等，实验室检查有精液常规检查评估生育能力等、血液检查含性激素等检查及前列腺特异性抗原等，影像学检查有阴囊超声等及前列腺超声等、X线检查用于诊断尿道狭窄等，其他检查有尿流率检查评估排尿功能及尿道镜检查直接观察尿道内部情况。
外生殖器检查：观察阴茎的大小、形态，有无畸形、硬结、损伤等；检查阴囊的大小、对称性，有无鞘膜积液、精索静脉曲张、睾丸肿大或萎缩等情况。不同年龄的男性外生殖器发育有不同特点，儿童期需关注是否有发育异常，成年男性则重点排查病理改变。生活方式方面，长期久坐、过度手淫等可能影响外生殖器血液循环，增加病变风险。
第二性征检查：查看毛发分布（如胡须、腋毛、阴毛等）、乳房发育情况等。男性第二性征受雄激素调控，雄激素水平异常会导致第二性征改变，如雄激素缺乏可能出现胡须稀疏、乳房发育等表现，不同年龄阶段第二性征的正常标准不同，青春期男性第二性征发育有其特定的进程。
实验室检查
精液常规检查：包括精液量、颜色、酸碱度、精子密度、活力、形态等指标。精液量正常范围一般在1.5-6毫升，精子密度正常应大于15×10?/毫升，精子活力分为前向运动、非前向运动等，正常精子形态率应大于4%。精液常规检查可评估男性生育能力，生活方式中吸烟、酗酒、高温环境等会影响精液质量，如长期吸烟的男性精液中精子畸形率可能升高；不同年龄男性的精液参数有差异，随着年龄增长，精液质量可能逐渐下降。
血液检查
性激素检查：包括睾酮、黄体生成素、卵泡刺激素等。睾酮是男性重要的雄激素，正常成年男性睾酮水平有一定范围，不同年龄阶段睾酮水平不同，青春期开始逐渐升高并维持一定水平。性激素水平异常可能导致性功能障碍、不育等问题，如睾酮水平过低可能引起性欲减退、勃起功能障碍等。
前列腺特异性抗原（PSA）：分为游离PSA和总PSA，主要用于前列腺疾病的辅助诊断，如前列腺癌的筛查等。不同年龄男性PSA参考值不同，一般年龄越大，PSA基础值可能略有升高，若PSA明显升高需进一步排查前列腺疾病。
其他血液生化检查：如肝肾功能等，可了解全身基本状况，因为一些全身性疾病可能影响男性生殖系统功能，如肾功能不全可能影响性激素代谢等。
影像学检查
超声检查
阴囊超声：可清晰显示睾丸、附睾、精索静脉等结构，有助于诊断睾丸附睾炎、精索静脉曲张、睾丸占位性病变等。精索静脉曲张在超声下可观察到精索静脉迂曲扩张等表现，不同年龄男性精索静脉曲张的发生率不同，青少年期也可能发生精索静脉曲张影响睾丸发育。
前列腺超声：能查看前列腺的大小、形态、结构等，对于前列腺增生、前列腺癌等有辅助诊断价值。不同年龄前列腺大小有差异，老年男性前列腺增生较为常见，通过超声可测量前列腺体积等指标。
X线检查：如排尿期膀胱尿道造影等，可用于诊断尿道狭窄、膀胱结石等疾病，了解尿道和膀胱的形态结构。对于有排尿困难等症状的男性，X线检查有助于明确病因，不同年龄男性尿道和膀胱的解剖结构有一定特点，检查时需根据年龄调整体位等操作。
其他检查
尿流率检查：通过测定尿液排出的速度等指标，评估排尿功能，对于诊断前列腺增生、尿道狭窄等引起的排尿障碍有重要意义。不同年龄男性尿流率正常范围不同，老年男性因前列腺增生等原因尿流率可能降低，检查时需保证足够的尿量等条件以获得准确结果。
尿道镜检查：可直接观察尿道内部情况，用于诊断尿道炎症、结石、肿瘤等病变。对于有尿道不适、排尿异常等症状且其他检查不能明确病因的男性可考虑进行尿道镜检查，检查过程中需注意操作规范，不同年龄男性尿道的生理弯曲等情况不同，儿童进行尿道镜检查需更加谨慎。
