小孩发育迟缓受遗传、母体、出生后等多因素影响，遗传因素有染色体异常和单基因遗传病致发育迟缓；母体因素包括孕期感染、营养不良、接触有害物质影响胎儿发育；出生后因素涵盖营养不当、疾病、心理及不良生活方式阻碍小孩生长发育。
单基因遗传病也可能引发发育迟缓，某些基因突变会影响身体的生长、代谢等过程，如先天性甲状腺功能减退症相关基因的突变，会导致甲状腺激素合成或分泌异常，进而影响小孩的生长发育速度，出现身材矮小、智力发育迟缓等情况。
母体因素
孕期感染：孕妇在孕期感染风疹病毒、巨细胞病毒等病原体，这些病毒可通过胎盘影响胎儿的正常发育。例如风疹病毒感染，可能导致胎儿出现先天性心脏病、白内障、生长发育迟缓等多种问题，因为病毒在胎儿体内繁殖会干扰细胞的正常分裂、分化等过程，影响器官的形成和生长。
孕期营养不良：孕妇在孕期如果营养摄入不足，如缺乏蛋白质、维生素（如维生素D、叶酸等）、矿物质（如钙、铁等），会影响胎儿的生长发育。维生素D缺乏会影响钙的吸收，导致胎儿骨骼发育不良；叶酸缺乏可能引起胎儿神经管发育异常，同时也会对整体的生长发育产生不利影响，因为这些营养物质是胎儿生长所需的重要物质基础。
孕期接触有害物质：孕妇在孕期接触铅、汞等重金属，或长期处于放射性环境中，这些有害物质会通过胎盘进入胎儿体内，干扰胎儿的正常生长发育过程。铅中毒会影响神经系统的发育，导致小孩出现智力低下、生长发育迟缓等症状，因为铅会抑制神经细胞的正常功能和代谢。
出生后因素
营养因素：小孩出生后如果喂养不当，如母乳不足且未能及时添加合适的辅食，或辅食添加不合理，导致蛋白质、能量、维生素等营养物质摄入不足，会引起生长发育迟缓。例如长期蛋白质摄入不足，会影响身体的生长和组织的修复，导致身高、体重增长缓慢。
疾病因素：某些慢性疾病会影响小孩的生长发育，如先天性心脏病，由于心脏功能受损，影响全身的血液循环，导致机体供氧不足，从而影响生长发育；慢性肾病会影响营养物质的代谢和排泄，导致小孩出现生长迟缓、贫血等症状；内分泌疾病如生长激素缺乏症，体内生长激素分泌不足或作用障碍，会使小孩的身高增长明显落后于同龄人。
心理因素：长期缺乏关爱、处于压抑的环境中，也可能影响小孩的生长发育。例如孤儿院中成长的小孩，由于缺乏足够的情感关怀和良好的生活照料，可能出现生长发育迟缓的情况，这是因为心理因素会通过神经内分泌系统影响生长激素等激素的分泌，进而影响生长发育。
不良生活方式：缺乏足够的运动也会影响小孩的生长发育，运动可以刺激骨骼的生长和肌肉的发育，长期缺乏运动的小孩可能出现身高增长缓慢等情况；长期睡眠不足也会干扰生长激素的分泌，生长激素在夜间深度睡眠时分泌旺盛，睡眠不足会影响生长激素的正常分泌，从而影响小孩的生长发育速度。
