消化器官包含口腔、咽、食管、胃、小肠（十二指肠、空肠、回肠）、大肠（盲肠、阑尾、结肠、直肠）及肛门，此外还有肝脏、胆囊、胰腺等辅助消化器官。
口腔：通过咀嚼和唾液淀粉酶初步分解淀粉，其中唾液中的溶菌酶可抑制细菌。婴幼儿乳牙未萌出时咀嚼功能受限，需避免过硬食物；老年人咀嚼能力下降可能影响消化效率，建议将食物切碎或煮软。
胃：通过胃酸和胃蛋白酶分解蛋白质，胃排空时间约4~6小时。胃溃疡患者需避免辛辣刺激食物，糖尿病患者因胃轻瘫可能出现腹胀，建议少食多餐。
小肠：主要消化场所，通过胰液、胆汁和肠液完成营养吸收，空肠吸收铁和维生素B12，回肠吸收胆盐和维生素B12。小肠梗阻患者需禁食，炎症性肠病患者应低渣饮食。
大肠：吸收水分和电解质，形成粪便，肠道菌群参与膳食纤维发酵。便秘人群需增加膳食纤维摄入，腹泻患者应避免生冷食物，孕妇因激素变化易便秘，可适当运动。
辅助器官：肝脏分泌胆汁乳化脂肪，胆囊储存胆汁，胰腺分泌胰液含多种消化酶。肝功能异常者需低脂饮食，胰腺炎患者需严格禁食，儿童期胰腺功能未完善，避免高脂饮食。
