女性HPV初期症状因感染部位和病毒类型而异，皮肤黏膜病变有寻常疣表现为黄豆大小、表面粗糙的丘疹，扁平疣表现为面部等部位扁平小丘疹；生殖器部位低危型HPV可致出现淡红色小丘疹等生殖器疣表现及相关不适，高危型HPV初期多无明显自觉症状，需靠筛查早期发现。
一、皮肤黏膜病变相关症状
1.寻常疣表现：HPV可引起皮肤出现黄豆大小的丘疹，表面粗糙，质地坚硬，呈灰褐色或正常肤色，可发生在身体任何部位，如手部等，一般无明显自觉症状，但在摩擦等情况下可能有不适感。这是因为HPV感染皮肤基底细胞后，导致细胞异常增殖分化，从而形成这样的皮损表现，其发生与机体免疫力等因素有关，免疫力较低的女性相对更易出现此类情况。
2.扁平疣表现：多发生在面部、手背等部位，表现为扁平的小丘疹，大小如针头至米粒，颜色可为淡褐色、肤色等，数目较多且密集分布。它是由特定型别HPV感染引起，发病机制是HPV病毒基因组整合到宿主细胞基因组中，刺激细胞增生，其发生也受女性自身免疫状态影响，当免疫力波动时可能诱发扁平疣出现。
二、生殖器部位相关症状
1.低危型HPV引起的生殖器疣表现：如果是低危型HPV感染生殖器部位，初期可能会出现单个或多个淡红色小丘疹，质地柔软，顶端稍尖锐，随着病情发展可逐渐增多增大，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等外观，患者可能会有外阴瘙痒、灼痛或性交不适等症状。这种情况在有不洁性生活史等高危行为的女性中更易发生，因为不洁性生活会增加HPV感染生殖器的风险，而女性自身的生殖系统局部环境等因素也会影响感染后的表现，比如局部潮湿、卫生状况不佳等可能促进疣体的生长。
2.高危型HPV持续感染相关潜在症状：大部分高危型HPV感染初期可能没有明显的自觉症状，容易被忽视。但长期持续感染高危型HPV可能会导致宫颈等部位的病变逐渐发展，不过在初期往往没有特异性的局部症状表现，需要通过定期的宫颈癌筛查等手段来早期发现异常情况。这是因为高危型HPV的致癌机制是病毒的癌基因整合到宿主细胞基因组中，干扰细胞正常的生长调控机制，但在早期细胞变化较隐匿时没有明显的局部症状显现，女性的年龄因素也有影响，一般随着年龄增长，机体免疫力相对下降，对HPV感染的清除能力可能减弱，更易出现高危型HPV的持续感染情况。
