感染HPV病毒有低危型和高危型之分，低危型可致生殖器疣（尖锐湿疣）、婴幼儿呼吸道乳头瘤病；高危型初期多无症状，病情发展可致宫颈病变相关症状及其他部位癌前病变或癌变症状，不同人群感染后症状有差异，特殊人群如孕妇感染HPV也需密切监测。
生殖器疣（尖锐湿疣）：多见于性活跃的中青年人，好发于外生殖器及肛门周围皮肤黏膜湿润区。初起为单个或多个淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增多增大，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状。女性多见于大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛周等部位；男性多见于龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎部、会阴等部位。一般无明显自觉症状，部分患者可有异物感、灼痛、刺痒或性交不适。
呼吸道乳头瘤病：婴幼儿感染低危型HPV-6、HPV-11等型别时可能发生呼吸道乳头瘤病，表现为进行性声音嘶哑、呼吸困难等，多与母亲孕期感染HPV有关，通过产道感染。
高危型HPV感染症状
宫颈病变相关症状：在感染高危型HPV的初期，多数患者没有明显的临床症状。但随着病情发展，当引起宫颈上皮内瘤变（CIN）甚至宫颈癌时，可能出现阴道不规则流血，如接触性出血（性生活或妇科检查后阴道流血）、绝经后阴道流血；阴道分泌物增多，可为白色或血性，稀薄如水样或米泔状，有腥臭味。晚期患者根据病灶侵犯范围出现不同的继发性症状，如尿频、尿急、便秘、下肢肿痛等；癌肿压迫或累及输尿管时，可引起输尿管梗阻、肾盂积水及尿毒症；晚期可有贫血、恶病质等全身衰竭症状。
其他部位癌前病变或癌变症状：高危型HPV感染还可能引起其他部位的癌前病变或癌变，如外阴癌、肛门癌等，相应部位可出现肿物、溃疡、疼痛等症状，但相对较为少见。
不同年龄、性别、生活方式和病史的人群感染HPV后的症状可能存在一定差异。例如，女性由于生殖道解剖结构的特点，宫颈是HPV感染相关病变的常见部位；男性感染HPV后，外生殖器病变相对更易被察觉。有多个性伴侣、初次性生活年龄小、免疫功能低下（如患有艾滋病等免疫缺陷性疾病）的人群感染HPV后，发生相关病变的风险更高，出现症状的时间可能相对更早或病情进展更快。对于特殊人群，如孕妇感染HPV，需要密切监测，因为可能会对分娩方式等产生影响，且要关注胎儿是否受到感染等情况，但一般孕期感染HPV本身可能无特殊的孕期相关症状，多在产后检查时发现异常。
