HPV感染分为低危型和高危型，低危型HPV感染可致生殖器疣（好发于性活跃青中年，外生殖器及肛周等湿润区，初为小丘疹后增大呈乳头等样突起，有恶臭等）和复发性呼吸道乳头瘤病（儿童多见，致声音嘶哑、呼吸困难）；高危型HPV感染可引起宫颈癌前病变（多无症状或有接触性出血、分泌物增多等）及宫颈癌（早期无症状，随病情进展有阴道流血、排液，晚期有继发症状及全身衰竭等），不同人群感染后症状有差异。
一、低危型HPV感染相关症状
生殖器疣（尖锐湿疣）
好发人群与部位：多见于性活跃的青、中年人群，好发于外生殖器及肛门周围皮肤黏膜湿润区。男性多见于龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎部、会阴，同性恋者多见于肛门及直肠内；女性多见于大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛周。
症状表现：初期为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。颜色可为红色或污灰色。根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血。皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积，致有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。
复发性呼吸道乳头瘤病：多见于儿童，与HPV-6、HPV-11感染相关。表现为进行性声音嘶哑，甚至呼吸困难，喉镜检查可见喉部乳头瘤样病变。
二、高危型HPV感染相关症状
宫颈癌前病变及宫颈癌
宫颈癌前病变：多数无明显症状和体征，部分有接触性出血等，多见于性生活后或妇科检查后少量出血。也可表现为阴道分泌物增多，白色或血性，稀薄如水样或米泔状，有腥臭味。
宫颈癌：早期常无症状和明显体征，随着病情进展，可出现阴道流血，早期多为接触性出血，中晚期为不规则阴道流血；阴道排液，多数患者有白色或血性、稀薄如水样或米泔状、有腥臭味的阴道排液；晚期根据癌灶累及范围出现不同的继发症状，如尿频、尿急、便秘、下肢肿痛等；癌肿压迫或累及输尿管时，可引起输尿管梗阻、肾盂积水及尿毒症；晚期可有贫血、恶病质等全身衰竭症状。
不同年龄、性别、生活方式及病史的人群感染HPV后症状可能有所差异。例如，女性随着年龄增长，机体免疫力相对下降，感染高危型HPV后发生宫颈癌前病变及宫颈癌的风险可能增加；有多个性伴侣、性生活过早等不良生活方式的人群，感染HPV的几率及发生相关病变的可能性相对较高；有免疫缺陷病史（如艾滋病患者）的人群，感染HPV后更易出现持续感染及相关严重病变。
