HPV感染分为低危型和高危型，低危型HPV感染可致生殖器疣，初期为细小淡红色丘疹后增大增多，无明显自觉症状或有瘙痒等，儿童少见；还可致婴幼儿呼吸道乳头状瘤病，表现为进行性声嘶、呼吸困难。高危型HPV感染早期宫颈病变无症状，进展后可有阴道不规则流血、分泌物增多，性生活早、多伴侣、吸烟女性易感染；还可引发外阴癌、肛门癌等，外阴癌有瘙痒、肿块等，肛门癌有便血、坠胀等，相关高危人群需关注。
生殖器疣相关症状：低危型HPV（如6型、11型等）感染可能引发生殖器疣。在男性中，好发部位包括阴茎、阴囊、肛周等；女性好发于大小阴唇、阴道口、会阴、肛周等部位。初期可表现为细小的淡红色丘疹，随后逐渐增大、增多，表面凹凸不平，质地柔软，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。一般无明显自觉症状，部分患者可能有瘙痒、异物感、压迫感等。对于有高危性行为、多个性伴侣等生活方式的人群，更易感染低危型HPV出现生殖器疣症状。而儿童感染低危型HPV出现生殖器疣相对少见，但如果有不适当的密切接触等情况也可能发生，需特别关注其接触史等情况。
呼吸道乳头状瘤病症状：由低危型HPV（如6型等）引起，多见于婴幼儿。主要表现为进行性声嘶、呼吸困难等，是由于HPV感染呼吸道上皮导致的肿瘤样病变。婴幼儿的免疫系统发育尚不完善，更容易受到病毒感染引发此类较为严重的呼吸道症状，需要密切观察其呼吸情况和声音变化等。
高危型HPV感染症状
宫颈病变相关症状：高危型HPV（如16型、18型等）持续感染可能导致宫颈病变。在病变早期通常无明显症状。随着病情进展，可能出现阴道不规则流血，例如接触性出血（性生活后或妇科检查后阴道流血）、绝经后阴道流血等；阴道分泌物增多，可为白色或血性，稀薄如水样或米泔状，有腥臭味。对于有性生活史的女性，尤其是性生活开始年龄较早、多个性伴侣、吸烟等生活方式的女性，更容易感染高危型HPV并发展为宫颈病变，需要定期进行宫颈癌筛查来早期发现病变。不同年龄的女性感染高危型HPV后的宫颈病变表现可能因身体机能等有所不同，年轻女性免疫系统相对活跃，部分可依靠自身免疫力清除病毒，但年龄较大女性清除病毒能力下降，更易持续感染。
其他部位癌前病变或癌变症状：高危型HPV感染还可能引发其他部位的癌前病变或癌变，如外阴癌、肛门癌等。外阴癌可能表现为外阴瘙痒、局部肿块或溃疡，伴有疼痛等；肛门癌可能出现便血、肛门坠胀、疼痛等症状。但这些情况相对宫颈病变来说发生率较低，不过对于有相关高危因素的人群也需关注。例如有长期肛门局部不清洁、多个性伴侣等情况的人群，感染高危型HPV后发生肛门癌等的风险会增加。
