尖锐湿疣有诸多危害，对生殖系统可致尿道狭窄、影响生殖功能；心理上让患者有自卑等不良情绪并影响社交；有高危型HPV感染的可能癌变；孕妇患病会致胎儿产道感染相关疾病。
一、对生殖系统的影响
尖锐湿疣若发生在男性的尿道内，可能会引起尿道狭窄等问题，影响尿液的正常排出；女性患者若病变累及宫颈等部位，可能会对生殖功能产生不良影响，增加不孕不育的风险。有研究表明，尖锐湿疣患者的生殖系统局部微环境发生改变，干扰了正常的生殖细胞结合与着床过程。
二、心理方面的危害
尖锐湿疣是一种性传播疾病，患者往往会承受巨大的心理压力，产生自卑、焦虑、抑郁等不良情绪。因为疾病的羞耻感，患者可能会回避社交，影响正常的工作和生活。例如，很多患者会担心被他人知晓病情而遭受歧视，长期处于心理应激状态，严重影响心理健康。
三、癌变风险
部分尖锐湿疣由高危型人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，如HPV16、HPV18等亚型。长期不治疗或久治不愈的尖锐湿疣有癌变的可能，例如，生殖器部位的尖锐湿疣有可能发展为阴茎癌、宫颈癌等恶性肿瘤。据统计，一定比例的宫颈癌患者发病前有尖锐湿疣病史。
四、对胎儿的影响（针对孕妇患者）
孕妇患有尖锐湿疣时，在分娩过程中，胎儿通过产道可能会感染HPV，导致新生儿喉部乳头瘤病等疾病。这会严重影响新生儿的健康，给家庭带来沉重的负担。
