传染性软疣根治方法包括局部治疗（夹除术、冷冻治疗、激光治疗）和全身治疗（免疫力低下者可能需全身抗病毒治疗，多以局部治疗为主），治疗中要避免搔抓防自身接种传播，注意个人卫生防传染他人。
局部治疗：
夹除术：这是较为常用的方法，医生会用镊子将软疣小体完全夹除，然后局部涂抹碘伏等进行消毒。对于儿童患者，操作时需尽量安抚其情绪，避免因不配合导致操作困难或损伤周围皮肤。一般年龄较小的儿童在夹除时可能会因疼痛而哭闹，家长应在操作前给予心理安抚，操作过程中配合医生固定儿童身体。
冷冻治疗：利用液氮的低温作用使软疣组织坏死脱落。冷冻治疗可能会引起一定程度的疼痛，对于儿童患者，冷冻后要注意保护治疗部位，避免搔抓，防止继发感染。由于儿童皮肤较为娇嫩，冷冻治疗后要密切观察局部皮肤反应，如有严重红肿、水疱等情况及时就医。
激光治疗：通过激光的热能破坏软疣组织。激光治疗后局部会有创面，需要保持创面清洁干燥，避免沾水，预防感染。儿童患者在激光治疗后要注意休息，减少活动，防止创面摩擦。
全身治疗：对于免疫力低下的患者，如患有艾滋病等基础疾病的患者，在局部治疗的同时可能需要进行全身抗病毒治疗等，但这种情况相对较少见，一般以局部治疗为主。
传染性软疣具有传染性，在治疗过程中要注意避免搔抓，防止自身接种传播，同时要注意个人卫生，衣物、毛巾等物品要单独清洗消毒，避免与他人共用，以防传染给他人。
