布加综合征的治疗包括介入治疗和外科治疗，介入治疗有球囊扩张血管成形术（是首选方法，儿童需评估等）和支架置入术（球囊扩张后，儿童需考虑血管生长等，成人依病变选支架）；外科治疗有旁路手术（无法介入或效果不佳时，儿童考虑心脏承受力，成人综合评估）和肝移植术（终末期肝病患者适用，儿童考虑供体等，成人评估肝脏等）。
球囊扩张血管成形术：是目前治疗布加综合征的首选方法，尤其是对于短段肝静脉或下腔静脉狭窄或闭塞的患者。通过将球囊导管送至狭窄或闭塞部位，扩张血管，恢复血流。对于儿童患者，需充分评估血管直径等情况选择合适规格的球囊，操作时要轻柔以避免损伤血管。对于有基础肝病或特殊病史的患者，需综合考虑肝脏储备功能等因素来选择合适的球囊扩张时机和方式。
支架置入术：在球囊扩张后，对于存在严重狭窄或扩张后再狭窄的情况，可置入血管支架以维持血管通畅。对于儿童患者，支架的选择要考虑随生长发育血管可能的变化，成人则根据病变血管的具体情况选择合适长度、直径的支架。有既往腹部手术史等病史的患者，要注意血管周围解剖结构的变化对支架置入的影响。
外科治疗：
旁路手术：如腔-房转流术等，适用于无法进行介入治疗或介入治疗效果不佳的患者。对于儿童患者，手术需充分考虑其心脏等重要器官的承受能力，成人则根据全身状况、血管病变情况等综合评估是否适合旁路手术。有心脏基础疾病等病史的患者，要在术前对心脏功能等进行详细评估后再决定是否采用旁路手术。
肝移植术：对于已发生终末期肝病的布加综合征患者，肝移植是有效的治疗手段。儿童患者进行肝移植需要考虑供体来源、术后免疫抑制等诸多问题，成人则要评估肝脏病变程度、全身状况等，有其他严重系统性疾病等病史的患者需谨慎评估肝移植的可行性。
