引起急性上呼吸道感染的主要病原体是病毒（占70%~80%），如鼻病毒、冠状病毒、流感病毒等，其次为细菌（约20%~30%），如链球菌、流感嗜血杆菌等。病毒感染多通过飞沫传播，细菌感染常继发于病毒感染或直接入侵，免疫力低下人群（如儿童、老年人、慢性病患者）更易患病。
一、病毒感染
病毒感染占主导，常见病毒包括鼻病毒（引发普通感冒）、流感病毒（导致流行性感冒，伴高热、肌肉酸痛）、呼吸道合胞病毒（婴幼儿易感，可致毛细支气管炎）、腺病毒（可引发咽结膜热、肺炎）等。病毒通过呼吸道黏膜入侵，潜伏期1~3天，症状多为鼻塞、流涕、咽痛、咳嗽，部分伴发热。
二、细菌感染
细菌感染常为继发性，常见致病菌有A组溶血性链球菌（引发化脓性扁桃体炎，可伴脓点、高热）、肺炎链球菌（可致鼻窦炎、中耳炎）、流感嗜血杆菌（儿童中耳炎常见病原体）等。细菌感染症状更重，如脓痰、脓涕、扁桃体化脓，发热持续时间长，需抗生素治疗。
三、其他病原体
支原体、衣原体感染占比约10%~20%，多见于青少年及成人，表现为持续性干咳、咽痛，发热程度不一，需大环内酯类抗生素（如阿奇霉素）治疗。
四、特殊人群注意事项
儿童（6月龄~5岁）免疫系统尚未成熟，易并发中耳炎、肺炎，需避免接触感染源，出现高热不退、呼吸急促时及时就医；老年人（≥65岁）多合并基础疾病，感染后易诱发心衰、慢阻肺急性加重，应加强防护，必要时提前接种流感疫苗；孕妇需警惕病毒感染导致的早产风险，用药需严格遵医嘱。
