急性肾盂肾炎治疗药物以喹诺酮类（如左氧氟沙星）、头孢菌素类（如头孢曲松）、磺胺类（如复方磺胺甲噁唑）及氨基糖苷类（如阿米卡星）为主，疗程通常为10~14天。
初始经验性治疗：适用于症状明显有发热等全身感染表现者，常用喹诺酮类、头孢菌素类或复方磺胺甲噁唑，根据病情严重程度选择口服或静脉给药。
复杂性肾盂肾炎：合并糖尿病、尿路梗阻或免疫低下等基础疾病者，需延长疗程至14天以上，可联用氨基糖苷类或万古霉素，同时需排查并处理基础疾病。
无症状性菌尿肾盂肾炎：老年或糖尿病患者可能表现不典型，需通过尿培养明确病原菌后选择敏感药物，疗程通常7~14天，避免长期使用广谱抗生素。
孕妇及哺乳期女性：优先选择毒性较低的青霉素类（如阿莫西林）或头孢菌素类，禁用喹诺酮类及磺胺类，需在医生指导下用药，定期监测肾功能。
儿童患者：避免使用喹诺酮类，可选用头孢菌素类（如头孢噻肟）或青霉素类，需根据体重调整剂量，用药期间注意观察过敏反应及肾功能变化。
老年患者：需调整药物剂量以避免肾毒性，优先选择肾毒性低的头孢菌素类，同时加强血糖、血压监测，预防脱水及电解质紊乱。
