一、免疫功能严重受损人群。接受造血干细胞移植、实体器官移植术后的患者，以及长期使用糖皮质激素（每日剂量≥10mg泼尼松龙）、免疫抑制剂（如环孢素、他克莫司）的患者，其免疫防御能力显著下降，益生菌中的活菌可能通过肠道黏膜屏障移位入血，引发菌血症、败血症等感染风险，临床研究显示此类人群服用益生菌后感染发生率较普通人群增加30%~50%。
二、严重基础疾病急性发作期患者。重症急性胰腺炎（Ranson评分≥3分）、严重肠梗阻、假性肠梗阻患者，因肠道动力障碍和屏障功能受损，使用益生菌可能加重肠道负担，导致细菌移位或诱发炎症反应。此外，终末期肾病透析患者、先天性免疫缺陷病（如Wiskott-Aldrich综合征）患者，因肠道菌群调节机制紊乱或免疫功能缺陷，也需避免使用益生菌。
三、早产儿及低出生体重儿（出生体重<1500g）。胎龄<32周或出生体重<1500g的早产儿肠道屏障功能薄弱，益生菌可能通过未成熟肠道黏膜引发全身性感染，美国儿科学会指南明确建议此类新生儿避免常规使用益生菌。临床实践中，极低体重儿使用益生菌后败血症发生率较对照组升高2.3倍。
四、对益生菌成分过敏者。对双歧杆菌、乳杆菌等特定菌株或辅料（如乳糖、明胶）过敏的人群，服用后可能出现皮疹、腹痛、呼吸困难等过敏反应。此类人群使用前需进行过敏原检测，可选择无过敏风险的益生菌产品或采用其他替代干预措施。
五、严重肠道感染未控制者。伪膜性肠炎（艰难梭菌感染）、严重细菌性痢疾急性期患者，肠道内致病菌大量繁殖，此时使用益生菌可能促进病原体定植，加重病情。此类患者应优先通过抗生素（如甲硝唑）控制感染，待症状缓解后再评估益生菌使用必要性。
