乙脑的传染源主要是感染乙脑病毒的猪（尤其是仔猪），其次为牛、羊、马等家畜及鸟类，其中猪是最重要的动物传染源，其感染后病毒血症期短但病毒量高，易通过蚊虫叮咬传播给人类。
猪：主要动物传染源
猪是乙脑病毒在自然界循环的主要宿主，尤其是仔猪，感染后病毒血症持续时间虽短（约2~5天），但病毒浓度高，是蚊虫叮咬传播的关键来源。每年猪的感染高峰常早于人群发病高峰1~2个月，形成传播预警。
家畜：次要传播媒介
牛、羊、马等家畜也可能感染乙脑病毒，但其感染率和病毒血症水平通常低于猪，传播作用相对有限。鸟类感染后多为隐性感染，病毒血症持续时间短，传播风险较低。
人类：不典型传染源
人感染乙脑病毒后，病毒血症期较短（约1~3天），且病毒量较低，通过蚊虫叮咬传播给他人的可能性极小，因此人类作为传染源的作用可忽略不计。
特殊人群注意事项
未接种乙脑疫苗的儿童（6月龄~10岁）、免疫力低下者（如长期慢性病患者、老年人）及兽医、养殖户等职业暴露人群，需重点做好防蚊措施，如使用蚊帐、驱蚊剂，避免在蚊虫活跃时段（黄昏至清晨）暴露于户外。
