森林脑炎主要通过以下方式检查：发病1周内取脑脊液进行病毒分离或核酸检测，急性期血清及恢复期血清抗体效价4倍以上升高可确诊。
急性期症状检查：发病1~2周内，进行血常规检查，可见白细胞总数升高，中性粒细胞比例增加；脑脊液压力可能升高，外观清亮或微浑，白细胞数轻度至中度升高，以淋巴细胞为主，蛋白含量轻度升高，糖和氯化物正常。
病毒学检查：取发病初期的血液、脑脊液或脑组织标本，通过RT-PCR检测病毒核酸，或进行病毒分离培养，阳性结果可确诊。但病毒分离操作复杂，主要用于科研或疑难病例诊断。
血清学检查：采用ELISA方法检测患者血清或脑脊液中的特异性IgM抗体，发病后1周内即可检出，是目前最常用的早期诊断方法。恢复期血清抗体效价较急性期升高4倍以上，也可辅助确诊。
影像学检查：部分患者头颅MRI检查可见脑干、丘脑等部位异常信号，有助于排除其他神经系统疾病，但对诊断森林脑炎特异性不强。
特殊人群注意事项：儿童及老年人感染后症状可能更严重，需尽早检查并密切观察病情变化；孕妇感染后可能影响胎儿，需在医生指导下进行检查和治疗。
