乙肝干扰素治疗期间可能出现发热、寒战等流感样症状，多在用药初期发生；还可能有骨髓抑制（白细胞/血小板降低）、脱发、甲状腺功能异常等副作用。多数副作用在停药后可逐渐缓解，少数长期后遗症（如自身抗体持续阳性）需长期监测。
短期副作用：用药后1~2小时可能出现发热（38~39℃）、肌肉酸痛，持续数小时至2天，可提前用对乙酰氨基酚缓解；部分人出现轻度脱发，停药后3~6个月多恢复。
血液系统影响：常见白细胞降低（发生率约15%~30%），需每2周复查血常规，白细胞＜3.0×10?/L时需调整剂量或停药；血小板减少（发生率5%~10%）可能增加出血风险，需避免剧烈运动。
内分泌与自身免疫异常：约10%~20%患者出现甲状腺功能异常（甲亢或甲减），需定期监测甲状腺功能；少数出现自身抗体阳性（如抗核抗体），多无临床症状，停药后多数可恢复。
特殊人群注意事项：孕妇、哺乳期女性禁用；有严重心脏病、精神病史者慎用；老年患者需更密切监测血常规及肝肾功能；合并糖尿病或高血压者需加强血糖、血压管理。
长期后遗症：停药后少数患者可能出现持续的自身抗体阳性或轻度肝功能异常，需每年复查肝功能及病毒载量，避免自行停药或滥用药物。
