新生儿甲减的恢复概率因类型和治疗时机不同而有所差异，通常在20%至90%之间。
先天性甲减约占新生儿甲减的90%，若能在出生后3周内确诊并开始治疗，甲状腺功能及智力恢复正常的概率相对较大，约40%，但患儿通常需终生用药替代治疗；若在3周后才开始治疗，恢复概率可能降至20%左右，且可能对智力和生长发育造成一定影响。
暂时性甲减约占新生儿甲减的10%，多由母体孕期服用抗甲状腺药物（如甲巯咪唑）、母体甲状腺激素通过胎盘影响胎儿等因素引发，甲状腺组织本身无器质性损伤。这种甲减通常在出生后3至6个月内可自行恢复正常，恢复概率超90%，一般不需要特殊治疗，但需定期监测甲状腺功能。
因此，新生儿甲减的早期发现和规范治疗至关重要，家长应确保孩子接受新生儿疾病筛查，一旦确诊，及时就医并严格遵医嘱治疗。
