自闭症（孤独症谱系障碍）的病因尚未完全明确，目前公认是遗传、神经发育、环境、免疫及围产期等多因素交互作用的结果，无单一明确病因。
遗传易感性
双生子研究显示，同卵双生子自闭症共病率（60-90%）显著高于异卵（约10%），提示强遗传倾向；已发现数百个候选易感基因（如SHANK3、NRXN1等），其中SHANK3突变与约1%病例相关，多数为复杂多基因模式，需多个基因变异叠加及环境触发。有家族史者建议孕前进行遗传咨询与基因筛查。
神经发育异常
脑结构与功能异常为核心病理机制：尸检研究显示前额叶皮层神经元密度降低，fMRI研究发现社交任务中颞叶皮层过度激活、前额叶活动延迟；小脑体积较正常增大，突触修剪过程失衡（过度或不足），脑白质束连接完整性降低（如胼胝体纤维束异常），神经递质（血清素、多巴胺）调节紊乱，共同导致社交与认知缺陷。
环境触发因素
母体孕期感染（如风疹病毒、巨细胞病毒）可使后代患病风险增加2-3倍（美国CDC 2020年研究），感染产生的抗体可能通过胎盘影响神经发育；接触丙戊酸等抗癫痫药物（FDA 2018年黑框警告）、铅/汞等重金属暴露可能增加风险，但需结合遗传背景，无单一环境因素可独立致病。孕妇应避免感染、谨慎用药，定期产检监测胎儿发育。
免疫与肠道微生态
部分自闭症患者存在抗神经元自身抗体（如抗NMDA受体抗体），2021年《柳叶刀》研究发现患者肠道菌群多样性降低，双歧杆菌、乳酸杆菌丰度减少；短链脂肪酸（如丁酸）合成不足，肠道代谢物异常可能通过“肠-脑轴”影响血脑屏障通透性与神经炎症，触发神经发育障碍。
围产期高危因素
早产（胎龄<37周）、低出生体重（<2500g）、宫内缺氧、分娩时窒息等围产期并发症，可通过影响脑氧供与神经重塑增加发病风险（中国围产数据显示，早产儿自闭症风险是正常儿的3-5倍）。此类患儿需早期开展神经发育筛查（如丹佛II量表）与干预训练。
特殊人群注意事项：有家族史者应加强产前遗传咨询；孕妇需避免感染、滥用药物（如丙戊酸），定期产检；早产儿及低出生体重儿需早期神经发育监测与康复干预。
