避孕套对部分感染性疾病有防护作用，但有局限性，不同人群使用避孕套防护感染性疾病需注意相关事项，如成年人要选合适质量合格产品正确使用且避免多个性伴侣，青少年需正确认识及在性教育下正确使用，有基础病史人群用避孕套要注意质量、正确使用及防自身再感染等。
对于乙型肝炎病毒（HBV），使用避孕套也有防护作用。HBV主要通过血液、母婴和性接触传播，避孕套可以有效阻隔含有HBV的精液或阴道分泌物，从而减少感染HBV的几率。
对于单纯疱疹病毒（HSV）引起的性传播疾病，避孕套同样能起到防护作用。它可以覆盖可能感染HSV的部位，降低病毒传播的可能性。
避孕套防护作用的局限性
避孕套并不能完全杜绝所有感染性疾病的传播。首先，可能存在避孕套使用不当的情况，比如在性交过程中避孕套滑脱、破裂等，这就会使体液直接接触而导致感染。其次，有些感染性疾病可以通过避孕套无法覆盖的部位传播，例如尖锐湿疣，它不仅可以发生在生殖器的皮肤表面，还可能出现在会阴部的皮肤褶皱等避孕套不能完全覆盖的区域，所以避孕套对尖锐湿疣的防护也不是100%的。
对于一些通过口腔-生殖器接触传播的疾病，如某些口腔疱疹病毒感染，避孕套无法防护口腔与生殖器接触的情况，也就不能防止此类感染的发生。
不同人群使用避孕套防护感染性疾病的注意事项
成年人：成年人在使用避孕套时要选择合适尺寸、质量合格的产品，并且要正确掌握使用方法，在性交开始前就正确佩戴避孕套，性交结束后及时正确取下避孕套，避免在使用过程中出现滑脱或破裂情况。同时，要避免多个性伴侣，因为性伴侣越多，感染性疾病的风险越高。
青少年：青少年处于性发育阶段，在性活动中使用避孕套时，首先要正确认识使用避孕套对防护感染性疾病的重要性。家长和学校应该加强对青少年的性健康教育，让他们了解正确使用避孕套的方法以及其在防护感染性疾病方面的作用，并且要引导青少年树立健康的性行为观念，避免过早发生不安全性行为。
有基础病史人群：对于本身患有某些性传播疾病处于治疗期的人群，使用避孕套不仅是为了防止疾病传播给性伴侣，也是防止自身再次感染其他病原体加重病情。例如梅毒患者在治疗期间，使用避孕套可以减少与病原体的接触，促进病情的恢复。同时，这类人群在使用避孕套时要更加注意其质量和正确使用方法，因为患病期间身体抵抗力可能相对较低，更易受到其他病原体的侵袭。
