窦性心动过缓伴不齐可由多种因素引起，生理性因素包括长期体力劳动者因运动训练致心肌收缩力增强等、睡眠时迷走神经张力增高等；病理性因素涉及心血管系统疾病（如冠心病、心肌病）、内分泌系统疾病（如甲状腺功能减退症、高钾血症）、神经系统疾病（如颅内病变、迷走神经张力过高）；药物因素有β受体阻滞剂、钙通道阻滞剂等不当使用；其他因素包含电解质紊乱（如低钾血症）、中毒（如洋地黄中毒等）。
一、生理性因素
（一）运动员及长期体力劳动者
长期从事体力活动的人群，如运动员，其心脏功能较强，在静息状态下心率可能偏慢，这是因为长期的运动训练使心肌收缩力增强，每搏输出量增加，从而维持机体正常代谢时所需的血流量，此时可能出现窦性心动过缓伴不齐。例如，有研究表明，经常进行高强度耐力训练的运动员中，一定比例存在窦性心动过缓伴不齐的情况，这是机体适应长期运动负荷的一种生理性表现。
（二）睡眠状态
在睡眠过程中，人体代谢率降低，对心率的需求减少，迷走神经张力增高，可导致窦性心动过缓伴不齐。一般来说，成年人在深度睡眠时心率会较清醒状态下有所减慢，且可能出现心律的轻度不齐，这是正常的生理现象，与睡眠时自主神经功能的调整有关。
二、病理性因素
（一）心血管系统疾病
1.冠心病
当冠状动脉发生粥样硬化，导致血管狭窄或阻塞时，心肌供血不足，可引起心肌功能异常，影响心脏的电生理活动，从而出现窦性心动过缓伴不齐。研究发现，冠心病患者中发生窦性心动过缓伴不齐的概率相对较高，这是因为心肌缺血会干扰心脏的正常节律传导。
2.心肌病
如扩张型心肌病、肥厚型心肌病等。扩张型心肌病患者心肌广泛受损，心脏的收缩和舒张功能下降，可影响心率的调节；肥厚型心肌病患者心肌肥厚，心室充盈受限，也会导致心脏电活动异常，进而出现窦性心动过缓伴不齐。例如，扩张型心肌病患者由于心肌重构，心肌细胞电生理特性改变，容易出现心律失常包括窦性心动过缓伴不齐。
（二）内分泌系统疾病
1.甲状腺功能减退症
甲状腺激素分泌不足，机体代谢率降低，交感神经兴奋性下降，可使心率减慢。甲状腺功能减退患者常伴有窦性心动过缓伴不齐，这是因为甲状腺激素对维持正常心率和心律起着重要作用，甲状腺激素缺乏会影响心脏的节律调控。相关研究显示，甲状腺功能减退症患者中约有一定比例存在窦性心动过缓伴不齐的心电图表现。
2.高钾血症
血清钾离子浓度升高时，可抑制心肌的自律性、传导性和兴奋性，导致心率减慢，出现窦性心动过缓伴不齐。例如，肾功能不全患者若出现钾排泄障碍，容易发生高钾血症，进而影响心脏节律。严重的高钾血症还可能导致更严重的心律失常甚至心脏骤停。
（三）神经系统疾病
1.颅内病变
如颅内肿瘤、脑出血、脑梗死等累及颅内自主神经调节中枢的病变，可影响心脏的神经调节，导致窦性心动过缓伴不齐。因为颅内病变会干扰神经信号对心脏的调控，使得心脏的节律受到影响。例如，当脑出血发生在影响自主神经功能的脑区时，可能会出现心率的异常改变，包括窦性心动过缓伴不齐。
2.迷走神经张力过高
某些神经系统病变或刺激可导致迷走神经张力明显增高，从而引起窦性心动过缓伴不齐。比如颈部的手术、外伤等可能刺激迷走神经，导致其兴奋性增加，进而影响心脏节律。
三、药物因素
（一）β受体阻滞剂
如普萘洛尔、美托洛尔等，这类药物通过阻断β受体，抑制心脏的交感神经活性，从而减慢心率。长期或不当使用β受体阻滞剂可能导致窦性心动过缓伴不齐。例如，一些高血压患者长期服用较大剂量的β受体阻滞剂，可能会出现心率减慢及心律不齐的情况，这是药物的药理作用导致的。
（二）钙通道阻滞剂
像维拉帕米、地尔硫卓等，也可能影响心脏的传导系统，导致心率减慢，出现窦性心动过缓伴不齐。这类药物主要通过抑制心肌细胞的钙内流，减慢房室结的传导速度，进而可能影响窦性心律。在临床应用中，如果药物剂量使用不当或患者对药物敏感，就可能出现相关的心律失常表现。
四、其他因素
（一）电解质紊乱
除了高钾血症外，低钾血症也可能影响心脏节律。当血清钾离子浓度过低时，心肌的兴奋性、自律性等发生改变，可导致窦性心动过缓伴不齐。例如，长期腹泻、呕吐的患者容易出现电解质紊乱，若伴有低钾血症，就可能出现心脏节律的异常。
（二）中毒
某些物质中毒也可引起窦性心动过缓伴不齐，如洋地黄中毒。洋地黄类药物过量时，可干扰心肌细胞的钠-钾-ATP酶活性，影响心肌电生理活动，导致心律失常，其中包括窦性心动过缓伴不齐。另外，一些植物毒素、重金属中毒等也可能对心脏产生毒性作用，引发窦性心动过缓伴不齐。
