扁桃体炎的药物治疗包括抗生素类、抗病毒药物及对症治疗药物。抗生素类有青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类，分别针对不同情况及人群；抗病毒药物可选利巴韦林但需注意儿童不良反应；对症治疗可使用解热镇痛药如对乙酰氨基酚、布洛芬缓解发热咽痛等症状，使用时需注意相关事项。
一、抗生素类药物
青霉素类：如果是A组β溶血性链球菌引起的扁桃体炎，青霉素是常用药物，如青霉素G等，它通过抑制细菌细胞壁合成发挥杀菌作用，对大多数敏感的链球菌有良好抗菌活性，但要注意患者是否有青霉素过敏史，有过敏史者禁用。
头孢菌素类：二代头孢如头孢呋辛等对扁桃体炎常见致病菌有较好抗菌效果，通过与细菌细胞膜上的青霉素结合蛋白结合，阻碍细菌细胞壁合成，从而发挥抗菌作用。儿童使用时要根据年龄、体重等调整剂量，且需关注是否有头孢菌素过敏史。
大环内酯类：对于青霉素过敏的患者，可选用阿奇霉素等大环内酯类药物，它主要作用于细菌核糖体50S亚基，抑制细菌蛋白质合成，对支原体、衣原体等也有一定作用，但儿童使用时要注意胃肠道反应等可能。
二、抗病毒药物
利巴韦林：如果是病毒感染引起的扁桃体炎，利巴韦林有一定抗病毒作用，它能抑制肌苷单磷酸脱氢酶，阻断肌苷酸转化为鸟苷酸，从而抑制病毒RNA和DNA合成，但要注意其对儿童的不良反应，如贫血等，且需严格掌握适应证。
三、对症治疗药物
解热镇痛药：当扁桃体炎患者出现发热、咽痛等症状时，可使用对乙酰氨基酚，它通过抑制下丘脑体温调节中枢前列腺素（PGE1）的合成及释放，而产生周围血管扩张，引起出汗以达到解热作用，同时能抑制PGE1、缓激肽和组胺等的作用，提高痛阈而产生镇痛效果。儿童使用时要按体重计算剂量，注意避免过量引起肝损伤等。布洛芬也可用于退热镇痛，它通过抑制环氧化酶（COX）的活性，减少前列腺素合成，从而减轻炎症反应和疼痛感受，儿童使用时同样要注意剂量和不良反应。
