手足口病与疱疹性咽峡炎均由肠道病毒引起，但病原体、症状表现及传播特点有差异。手足口病多见于5岁以下儿童，口腔、手、足、臀部出现疱疹；疱疹性咽峡炎以咽峡部疱疹为主，全身症状较轻。
病原体差异：手足口病主要由柯萨奇病毒A组16型（CoxA16）、肠道病毒71型（EV71）引起；疱疹性咽峡炎多为柯萨奇病毒A组（如A2 - A6、A8、A10）或肠道病毒D组（如柯萨奇病毒D68）。
症状表现：手足口病典型症状为口腔黏膜疱疹（疼痛明显）、手足臀部皮疹（斑丘疹→疱疹→结痂），可伴低热；疱疹性咽峡炎表现为咽峡部灰白色疱疹及溃疡，咽痛剧烈，高热（38 - 40℃），偶伴呕吐，无手足皮疹。
传播途径：两者均经粪 - 口、呼吸道飞沫传播，接触污染物品（玩具、餐具）也可感染。手足口病传染性更强，幼儿园、家庭易爆发；疱疹性咽峡炎以集体单位聚集性发病为主。
病程与预后：两者均为自限性疾病，病程3 - 7天。手足口病重症罕见（多见于EV71感染），表现为神经系统症状（抽搐、意识障碍）；疱疹性咽峡炎极少重症，预后良好。
特殊人群注意：5岁以下儿童、免疫力低下者（如糖尿病、免疫缺陷）需加强防护，避免接触患者；出现持续高热、精神差、肢体抖动等症状时，应及时就医。
