多西环素和米诺环素均为四环素类抗生素，但在化学结构、抗菌谱、适应症及不良反应等方面存在差异。米诺环素半衰期更长，对某些耐药菌活性更强，而多西环素在肾功能不全患者中使用更安全。
化学结构差异
多西环素为半合成四环素类，米诺环素为长效半合成四环素类，二者均通过抑制细菌蛋白质合成发挥作用，但米诺环素在分子结构上增加了甲基和二甲氨基，使其抗菌活性更强，且不易产生耐药性。
抗菌谱差异
多西环素对革兰氏阳性菌、部分革兰氏阴性菌、立克次体、支原体等有效，常用于痤疮、衣原体感染；米诺环素除上述作用外，对耐青霉素、四环素的菌株效果更佳，适用于敏感菌引起的尿道炎、毛囊炎等，尤其对痤疮丙酸杆菌作用显著。
药代动力学差异
多西环素口服吸收完全，半衰期约12-22小时，每日1-2次给药；米诺环素半衰期更长（约16-18小时），每日1-2次，且组织穿透力强，脑脊液中浓度较高，适合中枢神经系统感染的辅助治疗。
不良反应差异
二者均可能引起胃肠道反应、光敏反应，但米诺环素更易导致头晕、头痛、前庭功能紊乱（如眩晕、平衡失调），尤其在驾驶或操作机械时需注意；多西环素对肾功能影响较小，肾功能不全患者可选用。
特殊人群注意事项
8岁以下儿童禁用四环素类药物，孕妇及哺乳期妇女慎用；米诺环素可能影响牙齿发育，哺乳期妇女需权衡利弊；老年人使用时需监测肾功能，避免长期大剂量使用。
