奥利司他胶囊可引发较多胃肠道相关反应如油性斑点、胃肠排气增多、大便紧急感等，部分有感冒样症状等全身性反应，长期使用可能影响脂溶性维生素吸收，孕妇禁用、哺乳期女性使用需谨慎、老年人需关注胃肠耐受状况、有肝胆疾病患者使用要格外留意。
一、胃肠道相关副作用
奥利司他胶囊主要通过抑制胃肠道脂肪酶活性来减少脂肪吸收，由此引发较多胃肠道相关反应。临床研究显示，约30%左右使用者会出现油性斑点，此乃未被吸收的脂肪随粪便排出体外所致；胃肠排气增多较为常见，患者可自觉肛门排气次数明显增加；部分使用者会有大便紧急感，还可能出现脂肪（油）性大便、脂肪泻、大便次数增多以及大便失禁等情况，这是药物作用于胃肠道脂肪消化吸收环节引发的直接结果。
二、全身性相关副作用
在全身性反应方面，部分使用者会出现感冒样症状，如乏力、头痛等表现，但其发生比例相较胃肠道反应较低。另外，还存在罕见的过敏反应，像皮疹、瘙痒等皮肤过敏现象，这是机体对药物成分产生免疫反应所导致。
三、对脂溶性维生素吸收的影响
长期使用奥利司他可能会影响脂溶性维生素（例如维生素A、D、E等）的吸收，因为奥利司他抑制了脂肪的消化吸收，而脂溶性维生素依赖脂肪的乳化才能被机体有效吸收，所以长期使用可能引发这类维生素缺乏的潜在风险。
四、特殊人群注意事项
孕妇：属于禁用人群，因奥利司他可能对胎儿产生不良影响。
哺乳期女性：使用时需谨慎，由于药物有可能通过乳汁分泌进而影响婴儿健康。
老年人：需关注自身胃肠道耐受状况，老年人群胃肠道功能可能减退，更易出现胃肠道副作用。
有肝胆疾病患者：使用时要格外留意，奥利司他主要经肝脏代谢，肝胆疾病会影响药物代谢及副作用发生风险。
