α糖苷酶抑制剂有多种不良反应，包括胃肠道反应，如用药初期部分患者腹胀等，有胃肠道基础疾病者需谨慎；低血糖相关反应，单独用时不引起，与其他降糖药联用时可能增加风险，老年患者需密切监测；肝肾功能影响，常规剂量影响小，严重肝肾功能不全者需谨慎；过敏反应，极少数出现皮疹等，有过敏史者需谨慎；还有个别患者可能出现头痛、乏力等少见不良反应，均需根据情况处理
低血糖相关反应
单独使用α糖苷酶抑制剂一般不会引起低血糖，但与其他降糖药物（如磺脲类药物、胰岛素）联用时，可能增加低血糖的发生风险。当与磺脲类药物联用时，磺脲类药物刺激胰岛β细胞分泌胰岛素，若此时同时服用α糖苷酶抑制剂延缓了碳水化合物的吸收，可能导致血糖升高不明显，而磺脲类药物持续作用使胰岛素分泌过多，从而引发低血糖。对于老年患者，由于其对血糖波动的调节能力较差，发生低血糖时症状可能不典型，更容易出现严重后果，需密切监测血糖。
肝肾功能影响
目前大量研究表明，常规剂量的α糖苷酶抑制剂对肝肾功能影响较小。但对于严重肝肾功能不全的患者，由于药物的代谢和排泄可能受到影响，需要谨慎使用。因为肝肾功能不全时，药物的清除率降低，可能导致药物在体内蓄积，增加不良反应发生的风险。例如，有严重肝病的患者，其肝脏对药物的代谢能力下降，服用α糖苷酶抑制剂后，药物在肝脏的代谢受阻，可能会在体内积聚，影响身体健康。
过敏反应
极少数患者可能出现过敏反应，表现为皮疹、瘙痒等。如果出现过敏症状，应立即停药，并采取相应的抗过敏治疗措施。对于有药物过敏史的患者，在使用α糖苷酶抑制剂前应详细询问过敏史，谨慎用药，避免再次发生过敏反应。例如，曾经对其他类似作用机制药物有过敏史的患者，使用α糖苷酶抑制剂时需高度警惕过敏情况的发生。
其他少见不良反应
还有报道显示个别患者可能出现头痛、乏力等不适，但相对较为罕见。对于出现这些少见不良反应的患者，也需要密切观察病情变化，根据具体情况决定是否继续用药或采取相应的处理措施。
