尖锐湿疣由HPV感染引起，口服药物非主要治疗方式，免疫调节剂如干扰素、转移因子可辅助调节免疫，但单独用难治愈；抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦对HPV直接作用有限，多为辅助。治疗需个体化综合方案，结合局部治疗，特殊人群用药需谨慎，医生依病情等制定方案，且要性伴侣同查同治防再感染。
干扰素：具有抗病毒、抗增殖及免疫调节作用。可通过肌肉注射、皮下注射或损害内注射等途径给药，也有部分研究探索口服干扰素的效果，但相对注射等给药方式，口服干扰素的生物利用度等因素可能影响其疗效，且存在一定副作用，如流感样症状等，在儿童等特殊人群中使用需谨慎评估风险收益比。对于免疫功能正常的成年人，可作为辅助治疗手段，但不是首选的单一口服治疗药物。
转移因子：可将特异性和非特异性细胞免疫功能转移给受体，以提高受体的免疫功能。它是从健康人白细胞中提取制得的一种多核苷酸肽类物质，可口服。对于尖锐湿疣患者，可能有助于调节机体免疫功能，辅助清除病毒，但单独靠口服转移因子治愈尖锐湿疣的情况较少，多作为综合治疗的一部分。在儿童中使用转移因子时，要根据儿童的体重、年龄等调整用量等，且需密切观察是否有不良反应。
抗病毒药物
阿昔洛韦：属于核苷类广谱抗病毒药物，对单纯疱疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、EB病毒、巨细胞病毒及乙型肝炎病毒等有抑制作用，但对HPV的直接抗病毒作用相对有限。不过在尖锐湿疣合并其他病毒感染等情况下可能会使用，口服阿昔洛韦对于单纯疱疹病毒感染相关的一些症状有一定缓解作用，但对于尖锐湿疣本身的治疗，其单一口服治疗效果不是主要的。儿童使用阿昔洛韦时需严格按照体重计算剂量，因为儿童的肝肾功能发育不完全，药物代谢等与成人不同，要避免药物蓄积等问题。
伐昔洛韦：是阿昔洛韦的前体药物，口服后在体内水解为阿昔洛韦而发挥抗病毒作用，其生物利用度比阿昔洛韦高。同样，对于尖锐湿疣，单纯依靠口服伐昔洛韦来清除HPV病毒效果不确切，多是在综合治疗方案中作为辅助抗病毒药物使用。儿童使用伐昔洛韦也需要谨慎计算剂量，根据儿童的年龄、体重等因素调整，并且要关注可能出现的胃肠道反应等副作用。
需要强调的是，尖锐湿疣的治疗需要根据患者的具体情况采取个体化的综合治疗方案，口服药物只是其中的一部分，且单独依靠口服药物往往难以完全治愈尖锐湿疣，通常需要结合局部治疗方法，如激光、冷冻、电灼等物理治疗去除疣体，同时要注意性伴侣的同时检查和治疗，避免再次感染。在使用任何药物包括上述可能涉及的口服药物时，特殊人群如孕妇、哺乳期妇女、儿童等都需要更加谨慎，应在医生的严格评估和指导下使用，医生会根据患者的具体病情、身体状况等多方面因素来制定最合适的治疗方案。
