生殖器疱疹的一般治疗包括保持局部清洁干燥，用生理盐水清洗患处、水疱破裂涂抗生素软膏、穿宽松内裤，儿童选柔软透气棉质内裤，成人选合适宽松内裤材质款式，避免搔抓；药物治疗有核苷类抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦，分别有不同用法及注意事项；特殊人群中孕妇使用抗病毒药需谨慎评估，儿童用药要谨慎选药、严格按体重年龄算剂量并密切观察，免疫功能低下者治疗周期长、需大剂量药且要监测病情及基础病。
保持局部清洁、干燥：应每天用生理盐水清洗患处，避免继发感染。对于水疱破裂者，可涂抹抗生素软膏预防感染。要穿着宽松的内裤，减少局部摩擦。不同年龄人群在穿着上需注意，儿童要选择柔软、透气的棉质内裤，避免过紧；成年人则要根据自身舒适程度选择合适的宽松内裤材质及款式。
避免搔抓：防止水疱破裂后引发感染扩散，无论是儿童还是成人都要尽量克制搔抓的冲动，儿童可以通过转移注意力等方式避免搔抓患处。
药物治疗
抗病毒药物
核苷类药物：如阿昔洛韦，它能抑制生殖器疱疹病毒的DNA合成，起到抗病毒的作用。对于免疫功能正常的患者，可口服阿昔洛韦进行治疗；对于症状较严重的初发患者，也可静脉滴注阿昔洛韦。儿童使用时需严格按照体重等计算合适剂量，且要密切观察用药后的反应；孕妇使用时需谨慎评估利弊，因为阿昔洛韦在孕妇中的使用需要权衡胎儿的风险和治疗的收益。
伐昔洛韦：是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，疗效与阿昔洛韦相似，但服用次数相对较少，患者依从性较好。用法一般为口服，不同年龄及病情的患者用量不同，儿童使用时同样需要根据体重等调整剂量，孕妇使用也需谨慎评估。
泛昔洛韦：也属于核苷类抗病毒药物，口服后在体内转化为喷昔洛韦发挥抗病毒作用，对生殖器疱疹病毒有抑制作用。用药时要根据患者的具体情况，如年龄、肝肾功能等调整剂量，儿童和孕妇使用都需要谨慎考虑。
特殊人群注意事项
孕妇：生殖器疱疹孕妇可能会将病毒传染给胎儿，导致新生儿疱疹。孕妇使用抗病毒药物时需非常谨慎，如阿昔洛韦等药物在孕妇中的使用需要由医生评估病情后，权衡利弊再决定是否使用。一般初发的孕妇患者可考虑使用阿昔洛韦治疗，而复发患者的抑制疗法需谨慎选择。
儿童：儿童患生殖器疱疹相对较少，但一旦患病，在药物选择上要更加谨慎。应选择对儿童肝肾功能影响较小的药物，且剂量要严格按照儿童的体重、年龄等进行计算。在治疗过程中要密切观察儿童的症状变化及药物不良反应，如出现异常应及时就医调整治疗方案。
免疫功能低下者：如艾滋病患者合并生殖器疱疹时，治疗周期可能会更长，需要更大剂量的抗病毒药物，并且要密切监测病情及药物的不良反应。同时，要积极治疗基础疾病，提高机体的免疫功能，以更好地对抗生殖器疱疹病毒。
