生殖器疱疹病毒在出现症状前1-2天至症状完全消退后7-10天内具有传染性，尤其是在有临床症状（如水疱、溃疡）时传染性最强。
感染初期及无症状排毒期：初次感染时，病毒在体内复制活跃，即使未出现明显症状，也可能通过体液（如精液、阴道分泌物）传播病毒。部分感染者在感染数月内可能出现无症状排毒，持续时间因人而异。
症状发作期：当生殖器或肛周出现水疱、溃疡、疼痛或瘙痒时，病毒大量复制并通过破损皮肤黏膜排出，此阶段传染性最高。水疱液、溃疡渗出液及血液中均含有高浓度病毒，需避免性接触及共用个人物品。
症状消退期：水疱结痂、溃疡愈合后，病毒仍可能潜伏在神经节内。若局部皮肤黏膜仍有微小破损或分泌物，病毒可继续排出，此阶段传染性逐渐降低，但仍需持续至症状完全消退后7-10天。
特殊人群注意事项：孕妇感染可能通过母婴传播导致新生儿疱疹，需在孕期及分娩前告知医生并接受抗病毒治疗；免疫功能低下者（如HIV感染者、长期使用激素者）排毒时间可能延长，需更严格防护。
