新生儿咽下综合征诊断主要依据出生后1小时内出现呕吐，呕吐物为泡沫黏液或带少量血液，无其他异常表现，且无窒息、胎粪吸入等病史，结合羊水污染情况（如羊水被胎粪、胎脂污染）可初步诊断。
羊水污染相关诊断：若羊水呈黄绿色或深绿色（提示胎粪污染），新生儿出生后短时间内出现呕吐，需警惕咽下综合征，此类情况因胎儿在宫内吞咽被胎粪污染的羊水，导致胃肠刺激引发呕吐。
喂养后呕吐特点：若新生儿出生后经喂养（母乳或配方奶）后仍持续呕吐，且呕吐物中无明显奶瓣、黏液量少，同时排除幽门狭窄等器质性病变，需考虑咽下综合征，因胃内羊水未及时排空，喂养后刺激加重呕吐。
病史与体征辅助：询问母亲孕期有无胎膜早破（＞12小时易引发羊水污染）、产程延长等情况，观察新生儿有无窒息、呼吸急促等伴随症状，若仅呕吐而无其他异常，结合羊水污染史可确诊，必要时进行X线检查排除消化道畸形。
鉴别诊断要点：需与新生儿败血症、肠梗阻等鉴别，败血症常伴发热/体温不升、反应差，肠梗阻多伴腹胀、无排便，咽下综合征无此类表现，且呕吐物中羊水成分可通过实验室检查（如pH值测定）辅助区分。
