小儿疱疹性角膜结膜炎治疗包括局部治疗（用糖皮质激素滴眼液减轻炎症、抗病毒滴眼液抑制病毒复制）、全身治疗（病情严重等用抗病毒药物且注意指征和不良反应）、护理方面（眼部保持清洁避免揉眼、生活保证休息营养均衡），且要关注小儿特殊人群，注意药物对其各系统影响及心理状态。
一、局部治疗
1.糖皮质激素滴眼液：对于炎症反应较明显的患儿，可使用糖皮质激素滴眼液，如氟米龙滴眼液等，能减轻炎症反应，但需在医生严密监测下使用，因为长期或不恰当使用可能导致眼压升高等不良反应，尤其要关注儿童使用时的眼部反应及眼压变化情况。
2.抗病毒滴眼液：常用的有更昔洛韦滴眼液等，可抑制病毒的复制，针对疱疹病毒感染发挥作用，能帮助控制眼部的病毒感染状况，儿童使用时要注意药物对眼部黏膜的刺激等情况。
二、全身治疗
1.抗病毒药物：若病情较严重或有全身播散倾向等情况，可能需要全身使用抗病毒药物，如阿昔洛韦等，但要严格掌握用药指征，充分考虑儿童的年龄、体重等因素来确定用药相关情况，同时密切监测药物可能带来的不良反应，像对儿童肾功能等方面的影响等。
三、护理方面
1.眼部护理：保持眼部清洁，避免患儿用手揉眼，防止感染进一步加重，对于儿童要做好看护，防止其不自觉地揉眼，清洁眼部时要使用干净的棉签等物品轻柔操作。
2.生活护理：让患儿多休息，保证充足的睡眠，有助于身体的恢复，儿童的生活作息要规律，营造良好的休息环境，饮食上要注意营养均衡，保证维生素等营养物质的摄入，以增强机体的抵抗力，促进病情康复。
四、特殊人群注意事项
小儿处于生长发育阶段，在治疗过程中要特别关注药物对其各系统的影响。比如使用糖皮质激素时，要严格控制使用时间和剂量，因为儿童对糖皮质激素的代谢、耐受等与成人不同，长期或大量使用可能影响儿童的生长发育等；全身使用抗病毒药物时，要根据儿童的年龄准确计算药物剂量，密切观察药物不良反应，如神经系统症状等，一旦出现异常要及时处理。同时，要关注患儿的心理状态，儿童可能因眼部不适等产生焦虑情绪，家长和医护人员要给予关心和安抚，帮助患儿保持良好的心态配合治疗。
