甲状腺结节穿刺总体安全性较高，但仍有出血、感染、损伤周围组织、假阴性结果、心理影响等危害，特殊人群如儿童、孕妇、老年患者穿刺需更谨慎，要充分评估利弊。
出血：穿刺过程中可能损伤血管导致出血，一般为少量渗血，在局部形成小血肿，多数可自行吸收。但对于凝血功能异常的患者（如本身有出血性疾病或正在服用抗凝药物者），出血风险可能增加，严重时可能形成较大血肿，压迫周围组织，如压迫气管可引起呼吸困难等症状。例如，有研究表明，在凝血功能正常人群中，甲状腺结节穿刺后出血发生率较低，但在服用华法林等抗凝药物的患者中，出血风险会显著升高。
感染：虽然发生概率较低，但存在穿刺部位感染的可能。主要是由于穿刺操作时消毒不严格或患者自身免疫力低下等原因引起。表现为穿刺部位红、肿、热、痛，严重时可出现发热等全身感染症状。一般通过使用抗生素等治疗可控制，但对于免疫功能严重低下的人群（如艾滋病患者、长期大剂量使用免疫抑制剂者），感染风险更高且感染可能更难控制。
损伤周围组织：极个别情况下，可能会损伤周围的喉返神经、甲状旁腺等组织。损伤喉返神经可导致声音嘶哑等症状；损伤甲状旁腺可引起甲状旁腺功能减退，出现低钙血症，表现为手足抽搐等。不过，随着穿刺技术的不断提高，这种严重并发症的发生概率非常低。例如，通过超声引导下精准穿刺，可大大降低损伤周围组织的风险。
假阴性结果：穿刺取材可能不满意或存在误差，导致虽然进行了穿刺，但未能获取足够或具有代表性的细胞样本，从而出现假阴性结果，即实际上存在甲状腺结节恶变，但穿刺结果提示为良性，可能会延误病情。这与结节的位置、质地等因素有关，比如一些位置较深、质地较硬的结节，穿刺取材可能不太容易获取到有效的细胞成分。
心理影响：部分患者在穿刺后可能会因为对检查结果的担忧等出现心理压力增大、焦虑等情况。尤其是对于担心结节是恶性的患者，这种心理负担可能会持续较长时间，影响生活质量。例如，一些患者在穿刺后会反复担忧检查结果，出现睡眠障碍、食欲不振等表现。
对于特殊人群，如儿童，甲状腺结节相对少见，但如果需要穿刺，由于儿童的身体机能和心理特点，需要更加谨慎。儿童在穿刺时可能配合度较差，增加操作难度，同时儿童的甲状腺组织相对娇嫩，损伤周围组织的风险可能相对成人略高。对于孕妇，甲状腺结节穿刺一般在必要时进行，需要充分评估利弊，因为穿刺可能对胎儿有一定潜在风险，如辐射暴露（虽然穿刺用的超声辐射剂量非常低，但仍需谨慎）等，需要在严格权衡后决定是否进行穿刺。对于老年患者，往往合并有其他基础疾病，如心血管疾病、糖尿病等，需要在穿刺前充分评估患者的心肺功能、凝血功能等情况，因为老年患者凝血功能可能相对较差，出血风险相对较高，同时基础疾病可能会影响穿刺后的恢复等。
