脑瘤的发生是遗传因素、环境暴露、基因突变及免疫功能异常等多因素综合作用的结果，目前确切病因尚未完全明确，但已知电离辐射、遗传综合征、病毒感染等是主要危险因素。
一、遗传与基因突变因素
部分脑瘤与特定基因突变或遗传综合征密切相关，如神经纤维瘤病（NF1基因变异，患者易患视神经胶质瘤等）、结节性硬化症（TSC1/TSC2基因突变，常伴发室管膜下巨细胞星形细胞瘤）。此外，父母患有脑瘤史的人群，子女发病风险可能略有升高，但并非绝对遗传，多数脑瘤为散发病例。
二、环境与生活方式因素
长期接触电离辐射（如头部放疗史、职业暴露于射线环境）是明确危险因素，儿童期接受过头颈部放疗者，成年后脑瘤风险显著增加。此外，长期暴露于化学物质（如亚硝胺类、多环芳烃）、空气污染或装修材料中的挥发性有机物，可能通过影响细胞DNA修复机制诱发癌变。值得注意的是，手机等电子设备的电磁辐射目前尚无明确致癌证据，无需过度担忧。
三、病毒感染与慢性刺激
部分病毒感染可能与脑瘤发生相关，如EB病毒（EBV）感染与淋巴瘤样丘疹病等中枢神经系统淋巴瘤的发病有一定关联；人类乳头瘤病毒（HPV）感染可能通过免疫抑制间接增加脑部肿瘤风险。此外，脑部慢性炎症（如结核性脑膜炎后遗症）、脑外伤后的瘢痕组织长期刺激，可能增加胶质细胞异常增殖的概率。
四、免疫功能异常
免疫功能低下者（如器官移植术后长期服用免疫抑制剂、HIV感染者），脑部感染病毒或发生恶性肿瘤的风险更高。系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病患者，中枢神经系统受累概率也会增加，可能与免疫复合物沉积及免疫调节紊乱有关。
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