甲状腺功能减退（甲减）主要因甲状腺激素合成不足或分泌减少，常见原因包括自身免疫性甲状腺炎（如桥本甲状腺炎）、甲状腺手术切除或放射性碘治疗后、碘摄入不足或过量、长期精神压力等。
一、自身免疫性甲状腺损伤
自身免疫性甲状腺炎是成人甲减最常见病因。当机体免疫系统异常激活，产生针对甲状腺的抗体（如甲状腺过氧化物酶抗体TPOAb、甲状腺球蛋白抗体TgAb），持续攻击甲状腺组织，导致甲状腺滤泡细胞受损，无法正常合成甲状腺激素。桥本甲状腺炎是其中最典型类型，女性患病率约为男性的10倍，常伴随甲状腺肿大或质地变硬。
二、甲状腺手术或放射性治疗后
甲状腺结节、甲亢或甲状腺癌患者接受手术切除部分或全部甲状腺时，剩余甲状腺组织可能无法满足激素需求；放射性碘治疗甲亢时，高剂量碘辐射会破坏甲状腺细胞，导致激素合成能力下降。术后甲减发生率与切除范围相关，全甲状腺切除术后几乎100%发生甲减，部分切除者约30%~50%出现甲减。
三、碘摄入异常或药物影响
碘是甲状腺激素合成的关键原料，长期缺碘（如山区饮食单一）会导致甲状腺激素合成不足；过量碘摄入（如长期服用含碘药物、高碘饮食）可能诱发甲状腺组织自身免疫反应或激素代谢紊乱。此外，胺碘酮等抗心律失常药物、锂剂等精神科药物可能抑制甲状腺激素合成，引发药源性甲减。
四、先天性甲状腺发育异常
新生儿甲减多因先天性甲状腺发育不全（甲状腺缺如或发育不良）或甲状腺激素合成酶缺乏，导致出生后甲状腺激素分泌不足，影响生长发育和智力发育。此类患儿若未及时诊断治疗，可能发展为呆小症（表现为身材矮小、智力低下、面容粗笨）。先天性甲减筛查已纳入我国新生儿常规体检项目，早期干预可避免不可逆损伤。
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