男性生殖器疼痛可能由感染、外伤、炎症或结构异常等原因引起，需结合疼痛部位、伴随症状及病史综合判断，及时就医明确病因。
一、感染性炎症
泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎，细菌（如大肠杆菌）或支原体、衣原体感染尿道时，可引起尿道灼痛或刺痛，排尿时加重，常伴尿频、尿急、尿道分泌物（分泌物性质因病原体不同而异）。
生殖系统感染：前列腺炎（中青年男性高发）表现为会阴部、下腹部隐痛或坠胀感，疼痛可放射至腰骶部；附睾炎/睾丸炎多为单侧睾丸或附睾红肿热痛，常由细菌感染（如大肠杆菌）或病毒感染（如腮腺炎病毒）引发。
二、外伤或机械损伤
外力撞击：性生活中动作剧烈、运动损伤或意外撞击可能导致阴茎、阴囊软组织挫伤，表现为局部肿胀、皮下淤血或剧烈疼痛。
医源性损伤：导尿、尿道检查等操作可能短暂刺激尿道黏膜，引起排尿时疼痛或灼热感，通常数小时至1~2天内缓解。
三、性传播疾病
淋病/衣原体感染：淋球菌或衣原体感染尿道时，初期表现为尿道口红肿、刺痛，伴黄色或白色脓性分泌物，性交时疼痛加剧。
生殖器疱疹：HSV病毒感染导致生殖器部位出现簇集性小水疱，破溃后形成溃疡，伴明显灼痛或刺痛，病程约1~2周，易反复发作。
四、结构异常或慢性病
包皮嵌顿：包茎或包皮过长者，包皮上翻后卡住冠状沟，导致静脉回流受阻，阴茎头缺血水肿，剧痛难忍，需紧急复位。
尿道狭窄/结石：尿道炎症愈合后瘢痕狭窄或尿道结石可能阻塞尿道，引起排尿困难、尿流细弱或下腹部、阴茎部疼痛，疼痛程度与结石大小相关。
五、其他少见原因
若疼痛持续超过24小时、伴随高热/血尿/排尿困难，或反复发作，应尽快前往正规医院泌尿外科或男科就诊，避免延误治疗。以上内容仅作科普参考，具体诊断与治疗需遵医嘱。
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