萎缩性胃炎主要是幽门螺杆菌感染、胆汁反流、长期服用非甾体类抗炎药等因素所致。没有治疗萎缩性胃炎最好的方法这种说法，临床上一般通过加强生活管理、药物治疗以及手术治疗萎缩性胃炎。
1、加强生活管理
萎缩性胃炎患者应注意规律饮食，避免过饥或过饱。多吃新鲜的蔬菜、水果，避免吃腌熏、煎炸、霉变的食物，少摄入生冷、辛辣刺激性食物及过于油腻的食物，戒烟戒酒。保持心情愉悦，避免过度紧张、焦虑。
2、药物治疗
如果是幽门螺杆菌感染导致的萎缩性胃炎，可以遵医嘱采取四联疗法进行治疗，即1种质子泵抑制剂+2种抗生素+1种铋剂。质子泵抑制剂比如奥美拉唑、兰索拉唑等。抗生素可以选择克拉霉素、阿莫西林、甲硝唑等。铋剂可以选择枸橼酸铋钾、果胶铋等。如果胃黏膜糜烂症状较严重，可以在医生指导下使用铝碳酸镁、硫糖铝等胃黏膜保护剂减轻胃黏膜的损害。腹胀患者可以配合使用伊托必利、莫沙必利等促胃动力药帮助消化。
3、手术治疗
重度异型增生的萎缩性胃炎患者癌变的可能性较大，需要进行手术治疗去除增生组织，如胃镜下黏膜切除术，以降低胃癌的发生几率。
萎缩性胃炎经过及时、规范治疗后一般预后良好，对身体健康不会产生严重危害。但是如果延误病情，则可能会出现贫血、消化道出血，甚至胃癌等并发症。
