双侧甲状腺囊肿的病因及发病机制尚未明确，可能与遗传、碘缺乏、放射线损伤等原因有关，详情如下：
1、遗传
如果家族中有甲状腺疾病的人群，由于受到遗传因素影响，后代患有双侧甲状腺囊肿、甲状腺腺瘤的风险会高于正常人。
2、碘缺乏
地方性水、土壤、食物中缺碘导致日常饮食中碘摄入不足，都会导致甲状腺激素合成不足，使血液中甲状腺激素浓度降低，腺垂体分泌大量的促甲状腺激素，导致甲状腺肿大，诱发双侧甲状腺囊肿。
3、放射线损伤
当患者有其他甲状腺疾病，需要采取放射治疗时，放射线会损伤甲状腺组织，导致甲状腺滤泡出血、坏死，从而形成双侧甲状腺囊肿。
除以上相对常见的原因外，双侧甲状腺囊肿还可能和其他原因有关，比如自身抗体异常、内分泌异常、炎症等因素所致。甲状腺囊肿属于甲状腺良性病变，无明显不适者定期随访观察即可。有症状者通过规范治疗可以控制病情，一般预后良好，不必过度担忧。
