宝宝熟睡中咳嗽了两声就呕吐可能与生理性原因有关，也考虑与呼吸道感染、消化不良等病理性原因有关，具体治疗方法如下：
一.生理性原因
当宝宝睡着咳嗽时，胸腔压力增大的同时可能对腹腔产生压迫，导致腹腔压力升高。腹腔压力升高后，对胃部产生压迫，造成胃内容物反流，引起呕吐。此外，宝宝睡觉时，胃部处于水平状态，此时胃内容物更容易发生反流。
如果咳嗽是因为体位变动，导致呼吸道的分泌物误入气道所致的话，只需要调整体位，观察调换完体位后宝宝的状态就可以了。
二.病理性原因
1.呼吸道感染
当宝宝感染病毒、细菌等病原体后，有可能就会造成呼吸道黏膜破损，发生呼吸道感染。宝宝发生感染后，可导致呼吸道分泌物增多，分泌物刺激咽喉，可出现咳嗽的症状，另外，由于夜间后交感神经兴奋，呼吸道分泌物进一步增加，容易诱发咳嗽加重。而当病原体进入肠胃中可能导致宝宝肠胃功能异常，引起宝宝呕吐。
宝宝发生呼吸道感染后，应进行抗感染治疗，宝宝感染的病原体种类不同，使用的抗感染药物也不同，细菌感染引起的呼吸道感染可以在医生的指导下使用头孢克肟颗粒、阿莫西林颗粒等药物进行治疗；病毒感染引起的呼吸道感染可以听从医生的建议使用阿昔洛韦片、更昔洛韦胶囊等药物来治疗。此外，家长可以遵医嘱给宝宝使用氨溴特罗口服溶液、乙酰半胱氨酸颗粒、盐酸氨溴索口服溶液等止咳药缓解咳嗽症状。家长应根据温度变化，及时给宝宝增减衣服，预防呼吸道感染。
2.消化不良
如果宝宝晚上睡觉时吃过多的食物，或宝宝本身胃肠道功能发生异常时，可能会出现消化不良的情况，未消化的食物堆积在胃部，在宝宝熟睡后可能出现胃内容物反流，反流至喉咙时会刺激宝宝出现咳嗽呕吐的症状。
家长应注意睡前不要给宝宝吃得太饱，对于胃肠道功能较差的宝宝，家长也应在医生指导下使用多潘立酮片、枯草杆菌二联活菌颗粒、健胃消食片等药物促进宝宝胃肠道蠕动，帮助消化。家长平时应避免一次性给宝宝喂得过多，尽量选择易消化的食物，有助于预防消化不良。
除以上常见原因外，还有其他可能性原因，如阑尾炎、肠套叠、肠扭转等。如果是生理因素引起的不适，及时进行生活干预后，症状可以改善。如果宝宝症状比较明显且无好转迹象，家长需要及时带宝宝前往医院，通过腹部超声，腹部CT等检查手段明确病情，采取正规治疗，家长不可擅自用药，避免耽误治疗。一般积极治疗后，预后比较好，家长不用太过紧张。
