糖链抗原高可能是由于子宫内膜异位症、肺癌、乳腺癌等疾病引起的，针对不同的疾病采取不一样的治疗方法。
1.子宫内膜异位症
子宫内膜异位症可能是由于月经期血液逆流、医源性种植、淋巴及静脉扩散等因素引起的，也可能是体腔内上皮组织受到激素、经血等反复刺激而引起，还可能是遗传、免疫系统紊乱、感染等因素引起的，雌激素过高、系统性红斑狼疮等因素可能也会诱发此疾病。患者通过血清测定通常会出现糖链抗原升高的情况。
患者出现疼痛时，可以服用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等药物进行缓解，月经异常的患者可以服用甲地孕酮片、炔诺酮片等孕激素类药物进行缓解，对于轻度和中度的患者也可以使用抑制卵巢功能的促性腺激素释放激素激动剂药物进行治疗，有利于阻止病情的发展，比如注射用醋酸亮丙瑞林微球、醋酸戈舍瑞林缓释植入剂等，使用期间患者应监测血清雌激素的水平，以免发生不良反应。
患者还可以根据自身情况选择开腹或腹腔镜的两种手术途径进行治疗，对于保守治疗效果不佳、有生育需求的患者，可以选择单纯病灶切除术的手术方式进行治疗，如果年龄较大且无生育要求的患者可以选择全子宫及双附件切除术，如果是需要保留卵巢功能但没有生育要求的患者，可以选择单纯性子宫切除术的手术方式进行治疗。患者平时可以定期进行锻炼，可以促进身体的血液循环，有利于缓解疼痛感。
2.肺癌
肺癌可能是吸烟、空气污染、电离辐射、遗传、病毒感染等因素引起的，也可能是接触致癌因子引起的，比如氨气、石棉、甲醛等，还可能是肺结核、支气管扩张症等肺部疾病引起的。患者的血液中糖链抗原会明显升高。
如果患者是非小细胞肺癌中的腺癌可以选择分子靶向的治疗方式进行治疗，患者如果是肺癌早期、中期、中晚期非小细胞肺癌等情况，可以根据自身情况选择相应的手术方式进行治疗，术后应辅助化疗进行治疗，比如肺段切除术、全肺叶切除术、开胸手术、辅助胸腔镜手术等，对于局限晚期、高龄、心肺功能不全不能手术等患者可以选择放疗联合化疗的方式进行治疗，如果是严重心肝肾功能不全、年老体弱、骨髓功能不佳等情况的患者，则不建议进行放疗和化疗。患者平时应避免吸烟，尽量减少接触烟尘、车尾气等有害气体，以免导致病情加重。
3.乳腺癌
乳腺癌可能是遗传、月经初潮年龄早、绝经年龄晚、儿童时期接受胸部的放射线治疗等因素引起的，营养过剩、肥胖、过度饮酒等因素也可能会诱发此疾病，糖链抗原高是乳腺癌比较重要的标志。
如果是绝经前和绝经后的患者，可以服用枸橼酸托瑞米芬片、枸橼酸他莫昔芬片等抗雌激素药物进行治疗，如果患者出现肿块较大、腋窝淋巴结转移等症状时，可以选择化学药物进行治疗，从而干扰癌细胞的繁殖，比如多柔米星注射液、注射用紫杉醇等，如果是HER-2阳性的乳腺癌患者，可以选择靶向药物方式进行治疗，比如注射用曲妥珠单抗、帕妥珠单抗注射液等。
患者还可以根据自身状况选择手术方式进行治疗，手术后还应联合放疗或化疗，对于早期乳腺癌且需要保留乳房的患者，可以选择保留乳房手术进行治疗，如果是原位癌、微小癌、年老体弱不宜做根治术的患者，可以选择全乳房切除术来进行治疗，对于需要保留胸肌的患者，可以选择改良根治术进行治疗。患者平时应进行适当的运动来增强体质，有利于提高机体的抗病能力。
