疱疹性咽峡炎与手足口病的区别主要在于病原体、症状、并发症、传染性、预后等方面。
1、病原体
疱疹性咽峡炎主要由柯萨奇A组病毒引起，偶尔也有其他肠道病毒引起。
手足口病可由多种肠道病毒引起，其中以柯萨奇A组16型（CoxA16）和肠道病毒71型（EV71）最为常见。
2、症状
疱疹性咽峡炎主要表现为发热和口腔咽峡部疱疹，疱疹破溃后形成小溃疡，患儿常因咽痛而哭闹、拒食。部分患儿可伴有咳嗽、流涕、呕吐等症状。
手足口病除了口腔咽峡部疱疹外，还会在手、足、臀部等部位出现皮疹，皮疹不痒，不痛，不结痂，不留疤。部分患儿可伴有咳嗽、流涕、呕吐、头痛等症状。
3、并发症
疱疹性咽峡炎少数患儿可并发高热惊厥、脑炎、心肌炎等并发症。
手足口病极少数患儿可并发无菌性脑膜炎、脑炎、急性弛缓性麻痹、肺水肿、肺出血、心肺功能衰竭等并发症。
4、传染性
疱疹性咽峡炎传染性较强，主要通过密切接触和飞沫传播。
手足口病传染性更强，主要通过密切接触、飞沫传播和消化道传播。
5、预后
疱疹性咽峡炎大多数患儿预后良好，一般在1-2周内自愈。
手足口病大多数患儿预后良好，但少数患儿可能会发展为重症，需要及时治疗。
需要注意的是，疱疹性咽峡炎和手足口病的症状有时会比较相似，容易混淆。如果孩子出现发热、口腔疱疹或皮疹等症状，应及时就医，以便明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，家长应注意保持孩子的个人卫生，勤洗手，避免带孩子去人群密集的场所，以预防手足口病和疱疹性咽峡炎的发生。
