耳后骨膜下脓肿的预后通常与多种因素相关，总体来说，经过及时、规范的治疗，多数患者预后良好。
如果能早期诊断并积极进行治疗，比如及时遵医嘱应用足量、敏感的抗生素控制感染，如头孢克肟，同时行乳突根治术等手术清除病灶、引流脓液，一般可以有效控制病情，避免感染扩散引发严重并发症，如颅内感染等。在病情得到控制后，耳部及耳后的症状会逐渐缓解，脓肿消退，骨质破坏也可能逐渐修复，患者可基本恢复正常生活，听力也可能得到一定程度的恢复或保持稳定。
然而，如果患者未能及时接受治疗，或者病情较为严重，可能会出现一些并发症，如面神经麻痹、迷路炎等，这会影响患者的面部功能和听力，对生活质量造成一定影响。少数情况下，严重的感染扩散还可能危及生命。另外，如果治疗不彻底，残留有感染病灶，可能导致脓肿复发，需要再次进行治疗。
